配置pcr体系时需要加哪些
A. PCR体系怎么配
PCR Buffer50 mM KCl, 10 mMTris-HCl, 2.5 mMMgCl2, pH 8.3
200μM dNTPs指25ul体系中的dNTPs的终浓度。
0.2 μM invA primers,0.2 μM终浓度的配对链引物。
0.2μM sefA primers, 0.2 μM终浓度的自身链引物(下游引物)。
and 0.5 μM pefA primers
2.5U of Taq DNA polymerase,2.5U的Taq酶,一般Taq酶都是5U/ul的。
and 0.2μl of DNA template,0.2ul DNA模板。
剩余的体积用无菌水补足25ul。
(1)配置pcr体系时需要加哪些扩展阅读
设计PCR 引物时的一般原则:
1、引物长度- 一般15~ 30碱基,过短则特异性低; 过长则会引起引物间的退火而影响有
效扩增。
2、 避免内部二级结构,避免序列内有较长的回文结构,使引物自身不能形成发夹结构。
3、G/C 和A/T 碱基均匀分布,G/C 含量在45%~ 55% 之间,引物碱基序列尽可能选
择碱基随机分布,避免嘌呤、嘧啶的连续排列。
4、要避免两个引物间特别是3' 末端DNA 序列互补以及同一引物自身3' 末端的序列互
补,使它们不能形成引物二聚体或发卡结构。
5、引物3' 端碱基一般应与模板严格配对,并且3' 端为G、C 或T 时引发效率较高。
6、 引物5' 端碱基可不与模板匹配,可添加与模板无关的序列(如限制性内切酶的识别
位点、ATG 起始密码子或启动子序列等)。
B. 20微升pcr反应体系各种反应物分别应该加多少
10×扩增缓冲液2ul,4种dNTP混合物,各200umol/L 2ul,引物各10~100pmol 0.5ul,模板DNA 0.2ug,Taq DNA聚合酶0.2ul,Mg2+1.5mmol/L 1.5ul,加双或三蒸水至20ul。
PCR所用的酶主要有两种来源:Taq和Pfu,分别来自两种不同的噬热菌。其中Taq扩增效率高但易发生错配。Pfu扩增效率弱但有纠错功能。所以实际使用时根据需要必须做不同的选择。
(2)配置pcr体系时需要加哪些扩展阅读:
PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DNA片段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。
DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。