linuxr语言
1、下载wgethttp://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz2、解压:tar-zxvfR-3.0.1.tar.gzcdR-3.0.13、安装(当然也可以跳过)yuminstallreadline-develyuminstalllibXt-devel./configure4、配置环境并编译安装#如果使用rJava需要加上--enable-R-shlib(这个我不需要,所以加入到后面)#如果3没安装,那么后面加上:--with-readline=no--with-x=no./configure--prefix=/usr/R-3.0.1make$$makeinstall5、配置环境变量并生效vi.bash_profileexportR_HOME=/usr/R-3.0.1exportPATH=.:$R_HOME/bin:$PATH#试环境变量生效source.bash_profile6、命令行测试[admin@JDsoftware]$RWARNING:ignoringenvironmentvalueofR_HOMERversion3.0.1(2013-05-16)--"GoodSport"Copyright(C):x86_64-unknown-linux-gnu(64-bit)R是自由软件,不带任何担保。在某些条件下你可以将其自由散布。用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献.用'contributors()'来看合作者的详细情况用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。用'demo()'来看一些示范程序,用'help()'来阅读在线帮助文件,或用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。用'q()'退出R.>q()7、创建脚本测试(t.R)cd/opt/script/Rvimt.R#!/path/to/Rscript#第一行x<-c(1,2,3)#R语言代码y<-c(102,299,301)model<-lm(y~x)summary(model)8、测试:执行脚本RCMDBATCH--args/opt/script/R/t.Rmore/opt/script/R/t.Rout#查看执行的结果或者第二种方式Rscript/opt/script/R/test.R#结果直接输出到终端
⑵ R语言是一种什么样的语言
R 语言,一种自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。R 本来是由来自新西兰奥克兰大学的罗斯·伊哈卡和罗伯特·杰特曼开发,现在由“R 开发核心团队”负责开发。R 基于 S 语言的一个 GNU 计划项目,所以也可以当作 S 语言的一种实现,通常用 S 语言编写的代码都可以不作修改的在 R 环境下运行。
R 语言
R 的源代码可自由下载使用,亦有已编译的可执行文件版本可以下载,可在多种平台下运行,包括 UNIX(也包括 FreeBSD 和 Linux)、Windows 和 MacOS。R 主要是以命令行操作,同时有人开发了几种图形用户界面,其中 RStudio 是最为广泛使用的集成开发环境。
功能
R 内置多种统计学及数字分析功能。R 的功能也可以透过安装包(Packages,用户撰写的功能)增强。因为 S 的血缘,R 比其他统计学或数学专用的编程语言有更强的面向对象(面向对象程序设计, S3, S4 等)功能。
R 的另一强项是绘图功能,制图具有印刷的素质,也可加入数学符号。
虽然 R 主要用于统计分析或者开发统计相关的软件,但也有人用作矩阵计算。其分析速度可媲美专用于矩阵计算的自由软件 GNU Octave 和商业软件 MATLAB。
⑶ linux服务器安装R语言及Rstudio server
在linux服务器上使用R语言及Rstudio server
cat /etc/redhat-release: 查看服务器系统版本
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.e.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz
checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available
configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages
6.安装
make
make install
安装成功!
R #在命令行直接输入“R”即可进入R 编辑。
q() ##退出R编辑
7.安装R-studio-server
wget https://download2.rstudio.org/server/centos6/x86_64/rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm
yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm
8.R-studio-server的一些命令
rstudio-server start ##启动 rstudio
rstudio-server stop ## 关闭rstudio
rstudio-server status ## 查看rstudio 运行状态
运行rstudio-server status出现 “Active: active (running) ” 表示rstudio 已启动
rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安装错误
rstudio-server restart ##重启
ifconfig ##查看服务器ip地址。
查看运行中R进程
rstudio-server active-sessions
指定PID,停止运行中的R进程
rstudio-server suspend-session <pid>
停止所有运行中的R进程
rstudio-server suspend-all
强制停止运行中的R进程,优先级最高,立刻执行
rstudio-server force-suspend-session <pid>
rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server临时下线,不允许web访问,并给用户友好提示
rstudio-server offline
RStudio Server临时上线
rstudio-server online
8.rstudio-server系统设置
主要有两个配置文件,默认文件不存在(非必要,可不做修改)
/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf
vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8080#监听端口,默认是8787,可以不做修改
www-address=127.0.0.0#允许访问的IP地址,默认0.0.0.0
rstudio-server restart
vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30#会话超时时间
r-cran-repos= http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN资源库
rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安装,更改R所在目录。
9.通过浏览器连接Rstudio-server
直接打开浏览器,输入http://<服务器ip>:8787 ## 如果修改过rserver.conf文件,后面的8787端口改为相应的端口即可。
这里需要我们输入用户名和密码。关于用户名有2点注意事项:
(1).不允许使用system 用户登陆,即用户ids小于100的用户。只能用普通用户登录
(2).用户的认证可以使用RSA。
如果没有普通用户,可以添加:
useradd newname # 添加一个名为newname的用户
passwd newname ###给新用户newname 设置密码,密码需是复杂密码,否则可能通不过。
usermod -G happy newname ####将新用户newname添加到happy 用户组中,
在用useradd添加用户之后,在默认的情况下,该账号是暂时被封锁的, 也就是说,该账号是无法登录,须要用passwd命令来给新创建的用户设置密码之后才可以使用。
10可能存在的问题
10.1如果你的rstudio-server没有启动 很大程度是安装有误,这里我将我遇到的错误分享出来
rstudio-server verify-installation
There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that
it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not
configure with --enable-R-shlib.
这里就提到无法找到libR.so文件,原因是配置R语言文件时,没有加参数--enable-R-shlib.
这就必须要重新安装R语言。使用make uninstall 删除之前的安装,最好也删除R-3.6.1所在的文件夹,用“rm -r -f R-3.6.1".
使用rm 命令 -r 参数表示全部删除, -f 参数表示强制删除,不会提醒。 同时使用这两个参数要小心。
10.2 普通用户无法启动rstudio-server
sudo rstudio-server start## 以管理员方式执行命令
这时会需要输入密码并提示
xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.
如果不想出现上面的提示,就是给该用户提高权限,添加用户使用sudo的权利。
su root ###切换到root用户,如果有root权限的话。
chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的写权限
vi /etc/sudoers ###编辑sudoers文件,添加权限。
找到这行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (这里的xxx是你的用户名)
youuser ALL=(ALL) ALL
%youuser ALL=(ALL) ALL
youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
chmod u-w /etc/sudoers ##撤销sudoers文件写权限
⑷ linux虚拟系统中怎么安装最新版R语言
一.准备安装所需要的软件:
1.VMware虚拟机的下载和安装在我的博客中已经提到,这里就不再详细阐述。
2.下载一个redhat,因为redhat已经商业化了,推荐大家使用centos,如果自己有合适的linux安装版本,可以不使用这个。
二.在VMware虚拟机为RedHat Linux创建新的虚拟机 :
1.打开虚拟机,选择新建虚拟机:
2.选择自定义(这里选择典型可能会在安装过程中出现一个硬件找不到的错误,所以推荐选择自定义),然后点下一步:
3 作系统选择linux,版本不用修改:
4.命名,并选择虚拟操作系统的存放位置(位置所在硬盘空间最好大于5G):
5.给虚拟机分配内存(这个自己看情况,我的电脑内存是512,给虚拟机分配了256)
6.选择虚拟机网络类型(推荐使用桥接网络)
7.选择磁盘类型,这里选择IDE(这也是第三步选择自定义的原因,因为选择典型的话,系统会自动选择SCSI硬盘,而有的linux,主要是早的linux版本,不能使用SCSI硬盘,所以才会出现没有发现硬盘的错误)
8.指定磁盘容量(推荐大小为8g,基本够用了)
二、安装linux系统就很简单了,网上也有很多的教程。虚拟机和真实服务器基本么有什么差别。
三、linux下安装程序
1.yum 安装 直接敲yum install 后面跟软件名称,linux系统会自动到yum源上寻找你所要安装的软件,以及它所需要的依赖关系的软件等
2.rpm安装 也是直接敲rpm install后面跟软件名称,系统会到rpm源上寻找软件,但是可能会提示在安装它之前还需要安装其他的软件,yum会直接帮你安装,但是rpm不会,你需要自己安装
3.源码包安装 相对于yum和rpm安装。源码包安装比较麻烦,但是它相当于软件的定制版,你可以设定安装目录及安装参数等等,比较自由。
⑸ Linux与R语言的关系
2、解压:
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1
3、安装 (当然也可以跳过)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure
4、 配置环境并编译安装
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(这个我不需要,所以加入到后面)
# 如果3没安装, 那么后面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install
5、配置环境变量并生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH
# 试环境变量生效
source .bash_profile
6、 命令行测试
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME
R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
R是自由软件,不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。
R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。
用'demo()'来看一些示范程序,用'help()'来阅读在线帮助文件,或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.
> q()
7、创建脚本测试(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R
#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R语言代码
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)
8、测试:执行脚本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看执行的结果
或者第二种方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#结果直接输出到终端
⑹ linux服务器怎么运行r语言
我有点不太理解是什么意思……Linux系统都有对应的R软件版本,可以从R的官网下载,安装了之后直接打开R运行就好了吧。
⑺ 跪求!!Linux下用R语言画图的高手(Error in X11,unable to open connection to X11 display )
楼主图形界面是必须在X模式下显示的,就算你需要浏览一张图片也需要X。
除非你这个图片单纯由printf colour组成的。
if [ -n "$(pgrep -x X) ]; then
sudo killall X
fi
xinit &> /dev/null &
export DISPLAY=:0.0
你可以去问下你们老师,他绝对不敢说,比如说我打开office不需要启动X
⑻ 如何在linux环境下使用r语言
1、下载
wget http://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz
2、解压:
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1
3、安装 (当然也可以跳过)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure
4、 配置环境并编译安装
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(这个我不需要,所以加入到后面)
# 如果3没安装, 那么后面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install
5、配置环境变量并生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH
# 试环境变量生效
source .bash_profile
6、 命令行测试
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME
R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
R是自由软件,不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。
R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。
用'demo()'来看一些示范程序,用'help()'来阅读在线帮助文件,或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.
> q()
7、创建脚本测试(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R
#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R语言代码
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)
8、测试:执行脚本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看执行的结果
或者第二种方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#结果直接输出到终端
⑼ linux r语言写的包怎么使用
1、通过选择菜单:程序包->安装程序包->在弹出的对话框中,选择你要安装的包,然后确定。2、使用命令install.packages(package_name,dir)package_name:是指定要安装的包名,请注意大小写。dir:包安装的路径。默认情况下是安装在..\library 文件...
⑽ linux R语言运行脚本,提示载入程辑包,运行不成功
“载入需要的程辑包:”这种提示没什么大不了的,实在觉得烦就在脚本里导致出现这些东西的命令外面套一层suppressMessages()函数,比如suppressMessages(library(foreach))。
关键是后面提示的错误要解决。