癌症数据库

⑴ 临床数据需要共享+可以放在哪些公共数据库

摘要 美国国家癌症数据库(National Cancer Database, NCDB)是经国家认证的，由美国外科医师学会和美国癌症学会联合组建的，它是一个基于医院登记数据的临床肿瘤学数据库，来源于超过1500多个癌症委员会认证的机构。NCDB数据库可用于分析和跟踪恶性肿瘤患者的治疗过程和结局。数据库代表了全美超过70%的新诊断癌症病例和超过三千四百万个历史记录。

⑵ icgc数据库的数据需要log fpkm+1嘛

需要。
当我们使用TCGA表达数据，数据以gene-samplematrix形式整理好了，ICGC也是一个很大的癌症数据库，存放了几十种癌症的数据。我们需要将系数矩阵修改成gene-sample。

⑶ 常用的医药文献检索外文数据库有哪些

1.Pubmed

是医学,生命科学领域的数据库,旨在组织、分享科研领域信息。为用户提供文献检索,图片检索,影响因子查询,免费全文下载,国家自然科学基金统计分析等服务

如果是校外没有这些数据库账号，可以从seek68文献馆中找到。而且还省米。

⑷ 可切除 胃癌 PS=0 什么意思

可切除胃癌，很好理解，就是胃癌可以做手术。PS0分这个是一个身体状况评分，0分：活动能力完全正常，与起病前活动能力无任何差异。
1分：能自由走动及从事轻体力活动，包括一般家务或办公室工作，但不能从事较重的体力活动。

2分：能自由走动及生活自理，但已丧失工作能力，日间不少于一半日间时间可以起床活动。

3分：生活仅能部分自理，日间一半以上时间卧床或坐轮椅。

4分: 卧床不起，生活不能自理。

5分: 死亡。

⑸ 中英文医学文献检索的数据库各有哪些

常见的英文医学检索数据库：

1、Medline——世界上最着名的医学文献检索系统之一

2、AIDS Databases——有关艾滋病的临床实验、药物研制以及相关文献数据库

3、CANCERLIT——癌症数据库(National Cancer Institute)

4、CHID online——综合卫生信息数据库，提供有关卫生、卫生教育资源的题录、文摘等信息

5、ClinicalTrials.gov——向医患人员提供的临床实验信息数据库

6、DIRLINE——收集美国约17,000个政府机构、研究机构、公司、学术机构等信息

7、药物信息库——包含有9,000余种美国处方与非处方药物信息

8、HSTAT——包括有健康指南、评价、和消费者指南信息的全文数据库

9、NCCAM Resources——补充和替代医学资源

常见的中文医学检索数据库：

1、中国知网——知网，是国家知识基础设施的概念。

2、生物医学文献数据库——中国医科院信息研究所研制，综合性生物医学数据库，国内权威。

3、中国科学引文索引数据库——收集我国出版315种重要期刊，91-94年13万篇论文及45万引文摘要。

4、中医中药数据库——中国科学院科学数据库提供

5、中国中医药文献检索中心——由中国中医研究院信息中心制作，提供中医药方面的Web界面文献检

⑹ seer数据库的文章发不了了

需要获取权限。
这个数据库是挺好的，很规范，癌症患者都登记在册，这个系统最早是用于保险数据分析，现在有很多SCI文章是基于这个数据库发表。
美国国家癌症研究所监测，流行病学和最终结果数据库，简称SEER数据库The Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program of the National Cancer Institute (NCI)。收录范围：美国部分州县（约35％的美国人口）的发病率、死亡率和患病情况等信息。收录变量：定期收集患者人口统计学、原发肿瘤部位、肿瘤形态、部分免疫组化、诊断阶段、第一疗程以及生存状态随访的等临床回顾性数据。收录癌种：所涉及的肿瘤划分为9类：乳腺、结直肠、其他消化系统、女性生殖、淋巴&白血病、男性生殖、呼吸系统、泌尿系统及其它尚未确指明的类型（最大的四个癌症组是肺癌，结肠癌/直肠癌，乳腺癌和前列腺癌。）数据更新：SEER提交的数据将在每年的十一月进行检查，在第二年的四月份开放使用。

⑺ 分析miRNA的数据库都有哪些

1、starBase

一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间：2013年11月。

2、miRbase

众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接（如：PicTar）。最新版本发布时间：2010年9月。

3、ChIPBase

整合CLIP-Seq和ChIP-Seq的数据探讨microRNA的转录和转录后调控，构建转录因子->microRNA->靶标的调控网络。最新版本发布时间：2012年11月。

4、Tarbase

一个收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。最新版本发布时间：2009年1月。

5、miRecords

一个整合的microRNA靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间：2010年11月。

6、targetScan

基于靶mRNA序列的进化保守等特征搜寻动物的microRNA靶基因。是预测microRNA靶标假阳性率较低的软件。而且是microRNA领域大牛Bartel实验室开发的。最新版本发布时间：2009年4月。

7、PicTar

基于microRNA或microRNA靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microRNA靶基因。假阳性率也较低。是microRNA领域大牛Rajewsky实验室开发的。最新版本发布时间：2007年3月。

8、PITA

基于靶位点的可接性和自由能预测microRNA的靶标。是着名的生物信息学家Segal实验室开发的。最新版本发布时间：2008年8月。

9、RNA22

基于序列特征预测microRNA的结合位点。是几个流行的microRNA靶标预测软件的其中一个。IBM公司的研究团队开发的。最新版本发布时间：2007年。

10、miRanda和microRNA.org

是着名的MemorialSloan-Kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。miRanda的最新版本又叫mirSVR。最新版本发布时间：2010年8月。

11、MicroCosm

EMBL-EBI的Enright 实验室开发的microRNA靶标数据库。最新版本发布时间：2010年8月。

12、miRTarBase

整合实验证实的microRNA靶标的数据库。最新版本发布时间：2010年10月。

13、miRGator v2.0

整合microRNA表达、靶标和疾病相关信息的数据库。最新版本发布时间：2010年11月。

14、MiRNAMap

动物的microRNA基因及其靶标的数据库。最新版本发布时间：2008年1月。

15、miRDB

动物microRNA靶标预测和功能注释数据库。最新版本发布时间：2010年8月。

16、RNAhybrid

一个基于miRNA-target配对自由能预测microRNA的靶标。最新版本发布时间：2011年6月。

17、miRGen

microRNA基因和microRNA靶标数据库。最新版本发布时间：2007年1月。

⑻ seer数据库如何增加既往肿瘤信息

seer数据库Breast Subtype ( 2010+ )”属性增加既往肿瘤信息。
美国国家癌症研究所监测，流行病学和最终结果数据库，简称SEER数据库 [The Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program of the National Cancer Institute (NCI)]。

⑼ seer数据库可以下保险信息吗

seer数据库可以下保险信息。
SEER 数据库是由美国国立癌症研究所于 1973 年建立,是美国常用的癌症数据库 ,里面包括各式各样的肿瘤类型,如肺癌、乳腺癌、胃癌、结直肠癌、前列腺癌等等.

⑽ 美国SEER数据库怎么获取 就是那个有很多癌症病人数据的数据库，可以做研究发文章的，不知道怎么获取

这个数据库是挺好的，美国人比我们做的更规范，癌症患者都登记在册，这个系统最早是用于保险数据分析，现在有很多SCI文章是基于这个数据库发表。也是国内学者寻求大数据支持的一个好地方。我也去找过，官方网站全英文太复杂了，你可以去Tao宝搜搜，有人愿意帮忙的。我花过点钱，还是比较方便的。节约一个月的时间。现在这方面的数据文章被引用的比较多，所以杂志社比较愿意收这个数据库的文章。