gaussianforlinux
❶ linux各个版本的软件市场能安装
一、常见的office办公软件openoffice:免费开源的office办公软件redoffice: 从 OpenOffice 中衍生出开发云主机域名来的,类似于国产的麒麟系统。libreoffice:很多桌面发行版本都默认自带的,比如ubuntu,可用于一般的文档阅读和处理。Google Docs:网络协同办公非常好,基本的文档处理,内容演示都可以,而且相比本地的办公软件有着很大的优势。WPS:国产的office办公软件。VNote 笔记软件二、输入法搜狗输入法 for linux三、上网、通信Chrome浏览器Firefox浏览器微信 for LinuxQQ for Linux四、开发工具Atom编辑器Vscode编辑器Sublime Text编辑器eclipseVirtualBox 虚拟机五、影音娱乐网易云音乐《反恐精英:全球攻势(CS GO)》《Dota 2》关于linux系统中可以安装哪些软件问题的解答就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,如果你还有很多疑惑没有解开,可以关注开发云行业资讯频道了解更多相关知识
❷ Linux可以用ghost
linux 下是无法使用ghost的。
Linux主要受到Minix和Unix思想的启发,是一个基于POSIX和Unix的多用户、多任务、支持多线程和多CPU的操作系统。它能运行主要的Unix工具软件、应用程序和网络协议。它支持32位和64位硬件。
Linux继承了Unix以网络为核心的设计思想,是一个性能稳定的多用户网络操作系统。Linux有上百种不同的发行版,如基于社区开发的debian、archlinux,和基于商业开发的Red Hat Enterprise Linux、SUSE、oracle linux等。
(2)gaussianforlinux扩展阅读:
Linux不仅系统性能稳定,而且是开源软件。其核心防火墙组件性能高效、配置简单,保证了系统的安全。在很多企业网络中,为了追求速度和安全,Linux不仅仅是被网络运维人员当作服务器使用,Linux既可以当作服务器,又可以当作网络防火墙是Linux的 一大亮点。
Linux 具有开放源码、没有版权、技术社区用户多等特点 ,开放源码使得用户可以自由裁剪,灵活性高,功能强大,成本低。尤其系统中内嵌网络协议栈 ,经过适当的配置就可实现路由器的功能。这些特点使得Linux成为开发路由交换设备的理想开发平台。
❸ linux gaussian怎么安装linda
一、 背景介绍
Gaussian是目前计算化学领域内最流行、应用范围最广的商业化量子化学计算程序包。它最早是由美国卡内基梅隆大学的约翰·波普(John A Pople, 1998年诺贝尔化学奖)在60年度末、70年代初主导开发的。其名称来自于该软件中所使用的高斯型基组。最初,Gaussian的着作权属于约翰·波普供职的卡内基梅隆大学;1986年,约翰·波普进入美国西北大学后,其版权由Gaussian,Inc.公司所持有。Gaussian软件的出现降低了量子化学计算的门槛,使得从头计算方法可以广泛使用,从而极大地推动了其在方法学上的进展。
到目前为止,Gaussian已经推出了12个版本,包括Gaussian70、Gaussian76、Gaussian80、Gaussian82、Gaussian86、Gaussian88、Gaussian90、Gaussian92、Gaussian92/DFT、Gaussian94、Gaussian98、Gaussian03等,其版本数字也是该版本发布的年份。其中,每个版本发布后,还陆续发布了一些这些版本的修订版。目前最新的版本是Gaussian03 Revision D.01/D.02。
Gaussian程序是用FORTRAN语言编写的,它从量子力学的基本原理出发,可计算能量、分子结构、分子体系的振动频率以及大量从这些基本计算方法中导出的分子性质。它能用于研究不同条件下的分子和反应,包括稳定的粒子和实验上难以观测的化合物,例如瞬时的反应中间物和过渡结构。
Gaussian的并行模式是采用OpenMP来实现的。OPENMP的并行实现是针对共享内存的机器的,实现方法简单。因此Gaussian在共享内存的机器上,能获得很好的性能。对于跨节点的计算,Gaussian使用TCP Linda软件来实现。TCP Linda是一个虚拟共享内存的并行执行环境,它可以把一个通过网络连接的分布式内存的机群或工作站虚拟成共享内存环境,从而使像Gaussian这样的用OPENMP实现并行的程序能够在分布式内存的机器上运行。
二、 软件的安装设置
1、将压缩包解开
# tar zxf OPT-900N.taz //g03 E01以上版本支持上海处理器 (可以查看文件日期在2007年以后的)
2、准备环境变量文件g03.sh
放入g03源代码目录,如/home/users/mjhe/g03/
#cat g03.sh
g03root="/home/users/mjhe"
GAUSS_SCRDIR="/scratch"
export g03root GAUSS_SCRDIR
. $g03root/g03/bsd/g03.profile
3、准备运行脚本
放入算例目录,如g03test
> cat g03.pbs
###########################################################################
# Script for submitting parallel Gaussian 03 jobs to Dawning cluster.
# Lines that begin with #PBS are PBS directives (not comments).
# True comments begin with "# " (i,e., # followed by a space).
###########################################################################
#PBS -S /bin/bash
#PBS -N gaussian
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=1:ppn=8
##PBS -l walltime=860:00:00
#PBS -V
##PBS -q middle
#############################################################################
# -S: shell the job will run under
# -o: name of the queue error filename
# -j: merges stdout and stderr to the same file
# -l: resources required by the job: number of nodes and processors per node
# -l: resources required by the job: maximun job time length
#############################################################################
INFILE=$file
# Define variable "jobname".
jobname=`echo $INFILE | awk -F. '{printf $1}'`
username=`whoami`
# Define the location where Gaussian was installed and run a setup script, g03.profile.
g03root="/data/users/ceszhcy/"
GAUSS_SCRDIR="/state/partition1/tmp/"
export g03root GAUSS_SCRDIR
. $g03root/g03/bsd/g03.profile
# Make a directory in scr and .com and .g03 file to there.
GAUSS_RUNDIR=${GAUSS_SCRDIR}/${username}.${PBS_JOBID}
if [ ! -a $GAUSS_RUNDIR ]; then
echo "Scratch directory $GAUSS_RUNDIR created."
mkdir -p $GAUSS_RUNDIR
fi
cp $PBS_O_WORKDIR/${jobname}.* $GAUSS_RUNDIR
ORIG_PBS_O_WORKDIR=${PBS_O_WORKDIR}
cd $PBS_O_WORKDIR
# Setup for Gaussian 03:
# =======================
# Make a scratch directory if it doesn't already exist.
GAUSS_SCRDIR=${GAUSS_SCRDIR}/${username}.${PBS_JOBID}/${jobname}
if [ ! -a $GAUSS_SCRDIR ]; then
echo "Scratch directory $GAUSS_SCRDIR created."
mkdir -p $GAUSS_SCRDIR
fi
export GAUSS_SCRDIR
echo "Using $GAUSS_SCRDIR for temporary Gaussian 03 files."
# Define node list
cat $PBS_NODEFILE|uniq > $GAUSS_SCRDIR/tsnet.nodes
NODE_NUM=`cat $PBS_NODEFILE|uniq |wc -l`
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`
nodes=`cat $PBS_NODEFILE |uniq| awk '{printf("%s,",$1)}'`
sharecpu=`expr $NP / $NODE_NUM`
G03_NODEFILE="$GAUSS_SCRDIR/tsnet.nodes"
GAUSS_LFLAGS=" -mp 2 -nodefile $G03_NODEFILE"
export GAUSS_LFLAGS
echo pbs nodefile:
cat $G03_NODEFILE
#Run a Gaussian command file, water03.com, redirecting output to a file, water03.log
cd $GAUSS_RUNDIR
echo "%NProcShared=$sharecpu" > ${jobname}.Input.${PBS_JOBID}
if [ $NODE_NUM -ne 1 ];
then
echo "%LindaWorker=$nodes" >> ${jobname}.Input.${PBS_JOBID}
fi
grep -v nproc $INFILE |grep -v NProcShared |grep -v LindaWorker >>${jobname}.Input.${PBS_JOBID}
echo "Starting Gaussian run at" `date`
if [ $NODE_NUM -eq 1 ];
then
time g03 < ${jobname}.Input.${PBS_JOBID} > $GAUSS_RUNDIR/${jobname}.log
fi
else
time g03l < ${jobname}.Input.${PBS_JOBID} > $GAUSS_RUNDIR/${jobname}.log
fi
#time g03 < ${jobname}.Input.${PBS_JOBID} > ${jobname}.log
echo "Finished Gaussian run at" `date`
PBS_O_WORKDIR=${ORIG_PBS_O_WORKDIR}
echo $PBS_O_WORKDIR
mv $GAUSS_RUNDIR/${jobname}.* $PBS_O_WORKDIR
mv $GAUSS_SCRDIR/*.chk $PBS_O_WORKDIR
echo "$GAUSS_SCRDIR"
rm -Rf $GAUSS_SCRDIR
4、测试安装是否成功
准备算例test397.com
在算例目录下修改g03.pbs,然后执行qsub g03.pbs -v file=test397.com
cd ~/g03test
qsub g03.pbs -v file=test397.com
5、其他
三、 注意事项
1、本文命令、代码和超链接采用斜体五号字表示
2、算例文件名必须有两部分组成,前缀+后缀,中间用 . 隔开
3、需要修改一下两个文件以适应linda并行时的配置情况:
#vi /data2/home/test/g03/linda7.2/opteron-linux-I8/bin/LindaLauncher
/mf/giovanni/static/g03/linda7.2/opteron-linux-I8/bin/cLindaLauncher
#vi /data2/home/test//g03/ntsnet
/mf/giovanni/static/g03/linda7.2/opteron-linux-I8/bin/true_ntsnet
4、在所以参与计算的节点根目录上增加/scratch/,并设置开放的权限
mkdir /scratch
chmod 777 /scratch
5、其他
四、 参考文献
1 量子化学计算程序包GAUSSIAN 王涛 上海超级计算中心 上海 201203 [email protected]
❹ linux shell 字符变量的问题 本人为了用gaussian批量处理,从网上找了个脚本如下:
"怎么将outf里的字符放到g09 < ${inf} |tee的后面做输出文件" 什么意思?
g09 < ${inf} |tee ${outf} 的意思应该是 将inf变量重定向到g09并写入outf文件是吧.
❺ 支持linux的应用软件有哪些呢
基本不能使用。。
LINUX软件下载网站虽然有,但是安装麻烦。
QQ可以用,但是功能很弱。
MSN基本可用,
暴风影音只能在WINDOWS下用。
楼主对LINUX了解还不够,建议保留windows