ncbi数据库的使用

① 如何利用NCBI查询蛋白质等电点

NCBI无法查询蛋白质等电点，可以到swissprot查询。

这个NCBI没有相关的功能，这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性，可以到swissprot进行查询，查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。

另外NCBI开发有Genbank等公共数据库，提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具，可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析。

(1)ncbi数据库的使用扩展阅读：

NCBI开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。NCBI支持与推广多种医学及科技方面的数据库，如：三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）、孟德尔人类遗传（OMIM）等。

另外使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。可以进入NCBI后选择ConservedDomain中的Search。

除此之外这个网站Search的黄色部分其中CD-search只能提交单条序列，BatchCD-Search可以上传多条序列，里面收录的数据范围是比较广的，可以利用NCBI进行检索。

② NCBI是什么主要是做什么

NCBI (National Center for Biotechnology Information )是指美国国立生物技术信息中心。

理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表，出现了生命过程的语法，其最复杂形式就是人类。

阐明和使用这些字母来组成新的"单词和短语"是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。

基本研究

它的使命包括四项任务:

建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统。

实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究。

加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。

全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。

NCBI通过下面的计划来实现它的四项目的:

NCBI有一个多学科的研究小组包括计算机科学家，分子生物学家，数学家，生物化学家，实验物理学家，和结构生物学家，集中于计算分子生物学的基本的和应用的研究。这些研究者不仅仅在基础科学上做出重要贡献，而且往往成为应用研究活动产生新方法的源泉。

他们一起用数学和计算的方法研究在分子水平上的基本的生物医学问题。

这些问题包括基因的组织，序列的分析，和结构的预测。目前研究计划的一些代表是:检测和分析基因组织，重复序列形式，蛋白domain和结构单元，建立人类基因组的基因图谱，HIV感染的动力学数学模型，数据库搜索中的序列错误影响的分析，开发新的数据库搜索和多重序列对齐算法，建立非冗余序列数据库，序列相似性的统计显着性评估的数学模型和文本检索的矢量模型。

另外，NCBI研究者还坚持推动与NIH内部其他研究所及许多科学院和政府的研究实验室的合作。

③ NCBI有多少数据库，分别有什么作用

在生物医学信息学领域，数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同，如果要问NCBI过去，现在或将来会有多少数据库，恐怕连NCBI自己都说不清楚。要是一个一个数据库讲下来，9999个字肯定不够用。这里有一个列表供您参考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/。

NCBI的产生和发展是在美国和全球生物学高速发展，高通量数据急速产生，而缺乏有效的数据分析方法的背景下产生，起初它主要任务是数据的存储和查询。只不过其存储的数据大多以高通量数据为主，例如基因测序，基因组，SNP, 基因芯片,小分子化合物和GWAS数据等。这些数据的共享，极大地促进了生物信息学发展。

按照数据->样式->知识->智慧的发展模式，NCBI主要起到了一个为生物学家提供数据的角色。不过，NCBI目前也不断地在调整自己的角色。例如，生物医学文献。NCBI在从NLM继承过来的pubmed的基础，提供以PMC数据库为核心的全文文献服务。PubMed数据库应该是全球生物学家使用频率最高的数据库。NCBI最近对pubmed的改版，虽然没有实质性的改变，但其按照用户体验进行的修改，足见其对该数据库的重视。

另外，NCBI目前不断地在引入高学历生物学人才对其数据库的质量进行控制。以dbSNP为例，其正在通过与领域专家的合作将突变数据与人类表型数据进行关联。

总得来讲，NCBI的发展是与生物学高通量数据产生密切相关，它以经不在局限于提供数据存储与查询，其未来的发展必将发展为一个大型的、综合的知识库。到那时NCBI会不会免费，就要另当别论了。很显然没有人会将自己的手稿拱手让人。如果真有那么一天，不知道从中会产生多少专利和知识产权。

④ ncbi怎么用

ncbi使用教程
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2016-11-04 19054人看过
NCBI (National Center for Biotechnology Information）是指美国国立生物技术信息中心。理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表，出现了生命过程的语法，其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。在生物学研究中，NCBI提供了大量的生物信息分析工具以及文献。所以学号检索方法是进入新生物学领域的必备技能。Blast工具、PubMed文献数据库等。
工具/原料
浏览器 NCBI网址
方法/步骤
1/9 分步阅读
首先进入NCBI主页。

Map view演示，主要是找到相关基因在染色体上的位置，以人类IL-6基因为例。

点击Map View

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选择物种，点击Go；

设置filter，过滤信息；

点击Genes seq查询序列

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最后进入序列下载页面，可以直接下载。可以选择多种格式，一般选择fasta。

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通过clone查询相关基因的cDNA序列

选择clone数据库，search基因描述。

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对基因的蛋白质序列和mRNA查询。

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也可对序列进行查询。基因组展示。

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也可以查询序列信息。

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查询已知引物，通过probe数据库搜索。

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同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式，排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。

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注意事项
简单演示仍需深入了解

21世纪是生物科学的世纪

软件 NCBI
编辑于2016-11-04，内容仅供参考并受版权保护

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⑤ NCBI是什么主要是做什么

NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写，指美国国家生物技术信息中心，建立于1988年。

NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库（该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构）之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。

(5)ncbi数据库的使用扩展阅读：

NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能，而且都可以在NCBI的主页www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相应链接，其中多半是由BLAST功能发展而来的。

已故参议员克劳德·佩珀认识到计算机化信息处理方法对于进行生物医学研究的重要性以及赞助立法，该立法于1988年11月4日成立了国家生物技术信息中心（NCBI），作为国家医学图书馆的一个部门（NLM） ）在美国国立卫生研究院（NIH）。