化合物数据库
① 化合物MDL号是什么
贝尔斯坦号
Beilstein和Gmelin为当今世界上最庞大且享有盛誉的化合物数值与事实数据库,该数据库以电子方式提供包含可供检索的化学结构和化学反应、相关的化学和物理性质,以及详细的药理学和生态学数据在内的最全面的信息资源。
CrossFire Gmelin是关于无机和金属有机化合物的结构及相关化学、物理信息的数据库。现由MDL Information Systems发行维护。该数据库有两个信息来源,其一是1817年至1975年Gmelin Handbook主要卷册和补编的全部内容,另一个是1975年至今的111种涉及无机、金属有机和物理化学的科学期刊。记录内容为事实、结构、理化数据(包括各种参数)、书目数据等信息。
CrossFire Beilstein由MDL Information Systems GmbH,Beilstein Chemie Daten und Software GmbH推出。数据来源为1779年至1959年Beilstein Handbook从正编到第四补编的全部内容和1960年以来的原始文献数据。原始文献数据包括熔点、沸点、密度、折射率、旋光性、从自然产物或衍生物分离方法。该数据库包含八百万种有机化合物和五百多万个反应。用户可以用反应物或产物的结构或亚结构进行检索,更可以用相关的化学、物理、生态、毒物学、药理学特性、以及书目信息进行检索。在反应式、文献和引用化合物(如前体或组分)之间有超链接。
② 化学信息学的发展现状
伴随着药物发现和制造技术发展而产生的化学信息学最早是由Frank Brown 用下述简洁语言定义的:综合信息资源,将数据(data)转化为信息(information),将信息转化为知识(knowledge),并将它用于特定药物先导化合物的辨识和优化领域的一门学科。众所周知,由于组合化学的出现使得药物学发生了革命性的变化。现代药物设计可以利用计算化学的方法,通过分子建模和仿真虚拟合成各种化合物(solid phase synthesis)。但是,通过这种方法得到的可供筛选的化合物库非常庞大,理论上可以合成的类药分子超过1040个。显然,如果去实际合成每一个药物来进行筛选是不可能的,因此必须从大量的数据中总结出规律,并利用这些规律进行虚拟的高通量筛选(HTS),以减少需要实际合成的化合物,同时尽可能地接近目标化合物。面对如此大量的数据,需要将原本独立的化学、数学及计算机等学科融合起来,构建一系列计算技术工具,以便完成从数据到信息,从信息到知识的整个化学信息处理过程。这些技术工具不仅包括实验数据的分析处理,同时也包括分子各种性质的计算、化合物数据库的建立、分子的虚拟合成、QSAR的研究、化学结构和性质数据库的建立、基于三维结构的分子设计、统计方法的研究等。化学信息学正是在上述需求基础上发展起来的一门交叉学科。它综合了数学、化学、生物学、信息学、计算机应用、药物学等学科知识,主要研究如何适当地选取化合物库(library)的多样性(diversity)、如何表征药物分子特征、如何度量不同分子间的差异性、如何识别类药(drug like)分子、分子结构和生物性能(bioactivity)关系、如何研发相应的计算机软硬件等,这就包括了化学计量学及计算化学的研究任务和内容。
化学信息学方法与传统的化学计量学方法相比,更注重于有用信息的提取和更注重计算速度的提高。为满足信息提取的需要,它大量采用了人工智能领域和信息科学领域的先进方法和工具。例如,运用数据挖掘技术去发现大量原始数据中的隐含规则;运用特征提取技术和编码技术进行模式的表达;运用数据库技术完成大型数据的储存和搜索;运用计算机仿真技术模拟分子的合成,以及受体和配体之间的匹配等。而为满足计算速度方面的要求,它一方面采用更高性能的计算机硬件,如并行计算机等;另一方面研究设计更为高效的算法,以最大限度地利用计算机硬件所能提供的计算能力。显然,化学信息学所研究的问题已经超越了传统化学计量学所研究的范畴,现有的化学计量学方法难以解决分子设计研究领域大量出现的新问题。从这个意义上讲,化学信息学的创立和发展是化学学科拓展的历史必然。化学信息学在化学领域、化工领域、药物设计领域、材料科学领域等许多领域中都已得到广泛的应用。例如,在化工领域中,化学信息学被用来对反应条件进行优化和筛选催化剂等,这主要是通过对实验数据进行建模,然后使用该预测模型实现对实验工作的指导;在药物设计领域,主要被用来进行分子模拟、虚拟合成、构效关系分析、虚拟筛选等;在材料科学领域,化学信息学被用于分子模拟和分子设计,并在分子性能预测的基础上,从所设计的分子中筛选出进行实际合成的分子,以便得到经过性能优化的材料。
③ 上海有机化学研究所化学数据库怎么样
肯定很全 有机所化学多厉害
④ 上海化学化工数据库共享服务平台怎么样
挺全的,很好。
国家筛选中心与上海药物所联合设立了国家化合物样品数据库。
拓展资料:上海化学化工数据中心是上海研发公共服务平台下属上海科技基础数据库的一个重要组成部分。上海化学化工数据中心的目标是通过中心的组建集成社会资源,建立化学化工领域的科学数据共享机制,探索化学化工数据共享标准和相关技术,为上海和华东地区所有与化学化工有关的研究机构、生产、销售和使用单位提供公共信息平台和化学化工信息共享服务,降低研发成本,促进上海和长三角地区整体化学化工科技水平的提高。
上海化学化工数据中心将联合上海地区拥有化学化工信息资源比较集中的单位,综合现有信息资源,形成以基础化学数据为核心向化工产品和医药化学品延伸的的化学化工数据库群,建立化学化工信息服务平台和基本服务框架,通过Internet面向全社会提供化学化工信息的检索服务,形成以华东为主包括全国的企业用户群。
上海化学化工中心的服务平台是一个分布式的系统,每个合作单位都是一个服务节点,主节点依托上海有机化学研究所,通过上海化学化工数据中心的统一界面和标识进行服务。上海化学化工数据中心将借鉴相关单位的数据库建设成功经验,通过强化目标任务和合同管理协调参与单位的工作进展,通过联合、互助完成项目的建设目标。
⑤ 摩贝化学网站的化合物百科是什么类似化工大辞典嘛
官方对其化合物网络的说明:
摩贝化学品-化工词典MOLBASE拥有全球最大、最精准的免费化合物数据库,提供化学品名、CAS号、结构式等检索方式,化工词典全面涵盖MSDS数据、合成路线、化工生产方法和用途
⑥ 分子数据库的概述
本条目介绍一下全球免费让公众使用的化合物及药物分子数据库 ,对化学及药物研究特别有用。
(注意: 以下信息来自于美国MedKoo Biosciences, Inc。)
1.美国国家医学图书馆化学身份证(CHEMIDPLUS)数据库
该网页可检索药物化学结构,本网站可以用药物名称查找其化学结构. 此外,本数据库还可以查看毒性, 理化性质, 药品代码等。
2. 美国国家医学图书馆PUBCHEM数据库可检索药物化学结构
本数据库是美 国国家健康研究所(NIH)和美国国家医学图书馆(NLM)的大型药物分子库。NIH 是美国医学研究机构,下设27个机构和中心,也是美国健康与人类服务部的一个组成部分。它是一个重要的联邦机构,执行和支持基础、临床及可转化医学研究, 调查普通及罕见疾病的原因、治疗及治愈情况。PubChem数据库是美国国家卫生署分子库路线图计划的一个组成部分,是由NIH国家生物技术信心中心开发 的一个化学结构及分子生物活性综合数据库.
3。 美国国家癌症研究所(NCI)抗癌药药物词典
该数据收集了4000多条与癌症医学相关的术语和化合物性质。
4. 药物合成数据库(Drug SynthesisDatabase)
该数据是这个药物在线网推出的数据 库.本数据库提供近7000种已上市或在研药物的药物合成相关的信息,如药品名、结构式、化学名、CAS登记号、分子式、分子量、化学活性、开发阶段、研 究机构等。最大的优点是快速检索合成路线,并给出参考文献来源。
检索条件支持模糊查询,各输入条件间的检索关系为逻辑与(即AND关系)。检索条件选择其一即可查询。检索方法包括:
*药物名称:(注:包含通用名、商标名、研发代号、异名等)。如Loratadine、Cefpirome.
*化学名称:(注:包含CA命名、普通命名等)。
*CAS登记号:(注:美国化学文摘登记号)。
5. 有机合成方法数据库
Since 1921, OrganicSyntheses has provided the chemistry community with annual collections ofdetailed, reliable, and carefully checked proceres for the synthesis oforganic compounds. Some proceres describe practical methods for thepreparation of specific compounds of interest, while other proceresillustrate important synthetic methods with general utility. Each procere iswritten in considerably more detail as compared to typical experimentalproceres in other journals, and each reaction and all characterization datahas been carefully checked for reprocibility in the laboratory ofa member of the Board of Editors.
Organic Synthesesproceres may be accessed either via the tables of contents of indivialvolumes (journal mode) or by concting structure and keywordsearches (database mode). Specific in divial proceres can beaccessed via the table of contents for either the original annual volume orcollective volume in which the procere appeared. Database modeallows users to simultaneously search all volumes of Organic Syntheses bykeywords or by inputting structures and substructures. Structure searchingrequires the ChemDraw plugin which can be downloaded according to theinstructions found in the left margin. Articles from future volumes of OrganicSyntheses that are not yet incorporated in the searchable database can beaccessed on the Org Syn Express page.
6. 有机合成人名反应
该数据库是药物在线网推出的数据 库.TheOrganic Name Reactions (ONR) section is intended to serve the professionalchemist and student by describing organic chemical reactions which have come tobe recognized and referred to by name within the chemistry community. A selectgroup has been chosen for addition to this section. Each reaction descriptionis designed to be informative and representative of the pertinent literature;however, it is not meant to be comprehensive. The descriptions are composed ofthe following: (1) name(s) associated with the reaction, (2) the originaland/or primary contributor(s) connected with the discovery and/or developmentof the reaction, (3) a concise description of the transformation, (4) areaction scheme, (5) key references, and (6) cross references to other ONRbased on commonalities. The index included in this section also listssupplementary terms.
7. 有机合成反应库
该数据可是这个药物在线网推出的数据库.含有400多个有机合成人名反应。
8. 化学物质索引数据库(Chemical IndexDatabase)
该数据库是药物在线网推出的数据库。 本数据库为化学物质特性数据库,包含大量具药理活性及生物活性的物质性质信息数据。检索条件支持模糊查询,各输入条件间的检索关系为逻辑与(即AND关 系)。化学结构式为矢量格式图片,可利用系统自带图片预览工具或支持该格式的工具进行无损缩放查看。检索结果包括:(a) 索引信息:如物质名称、化学结构式图、化学文摘登记号(CAS)、CA名称、商标名、化学结构式、分子式、分子量、元素组成等。(b) 参考文献:提供公开物质理化性质、制备方法、分析方法、药理药效、临床研究等的重要期刊、专利、综述等极具参考价值的文献。(c) 物质特性:包括理化特性数据,如熔点、沸点、闪点、溶解性、多晶物质状态、光谱吸收特征数据、药物治疗分类等.
其检索的方法有:
*物质名称(英文名):(包含化学名、通用名、商标名、异名等的全名或部分(大于3个字符),如Ceftriaxone,Adefovir.)
*CA登记号(CAS Registry Number):
*注:美国化学文摘登记号
*参考文献(Literature References)
*药理活性(Keywords)
*用途(Usages)
*治疗分类(Therapeutic Category)
*分子式(Molecular Formula)
*分子量(Molecular Weight)
*熔点(Melting Point)
*注:熔点值,以摄氏度为单位
*沸点(Boiling Point)
*注:沸点值,以摄氏度为单位
*解离常数(pKa)
*比旋度(Optical Rotation)
*油水分配系数(LogP)
*最大吸收值(Absorption Maximum)
*密度(Density)
*折光率(Index of Refraction)
*毒性数据(Toxicity)
⑦ 有机化学哪些数据库比较好
有机化学类数据库存储的是与有机化学领域有关的各类信息。如关于有机化合物结构和各种性质的结构和事实库I3F I LSTEIN ,关于有机化学反应的数据库CASREACT, ChemlnformR},R},ACGS和CI I}.h'IREOCT ,关于CRC有机化学数据手册的数据库HUL7ClC等Chemical.AI、reaxys和Scifinder是有机合成常用的数据库。reaxys有遗漏,Scifinder运行成本较高,产品价格不显示。Chemical.AI是国产的非商业性的免费查合成路线工具。离线数据库不大好吧,更新速度不能确定,信息接收速度会很慢的。数据库(Database)是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库,它产生于距今六十多年前,随着信息技术和市场的发展,特别是二十世纪九十年代以后,数据管理不再仅仅是存储和管理数据,而转变成用户所需要的各种数据管理的方式。数据库有很多种类型,从最简单的存储有各种数据的表格到能够进行海量数据存储的大型数据库系统都在各个方面得到了广泛的应用。在信息化社会,充分有效地管理和利用各类信息资源,是进行科学研究和决策管理的前提条件。数据库技术是管理信息系统、办公自动化系统、决策支持系统等各类信息系统的核心部分,是进行科学研究和决策管理的重要技术手段。数据库(Database)是按照数据结构来组织、存储和管理数据的建立在计算机存储设备上的仓库。简单来说是本身可视为电子化的文件柜——存储电子文件的处所,用户可以对文件中的数据进行新增、截取、更新、删除等操作。在经济管理的日常工作中,常常需要把某些相关的数据放进这样的“仓库”,并根据管理的需要进行相应的处理。例如,企业或事业单位的人事部门常常要把本单位职工的基本情况(职工号、姓名、年龄、性别、籍贯、工资、简历等)存放在表中,这张表就可以看成是一个数据库。有了这个"数据仓库"我们就可以根据需要随时查询某职工的基本情况,也可以查询工资在某个范围内的职工人数等等。这些工作如果都能在计算机上自动进行,那我们的人事管理就可以达到极高的水平。此外,在财务管理、仓库管理、生产管理中也需要建立众多的这种"数据库",使其可以利用计算机实现财务、仓库、生产的自动化管理。