体的数据库
‘壹’ 代谢组学常用数据库介绍
代谢组学数据库是代谢组学检测的关键,用于物质鉴定,以下是一些常用的代谢组学数据库介绍。
一、人体代谢组数据库(HMDB)
免费电子数据库,包含人体小分子代谢产物信息,应用领域广泛,如代谢组学、临床化学、生物标志物发现,包含114,026个代谢物记录。
二、METLIN
创建于2003年的METLIN数据库,包含超过100万个分子,包括脂类、类固醇等,数据在多种仪器上生成,包括SCIEX、安捷伦等。
三、MssBank
网络开放数据库,公开分享从化学标准品得到的质谱图,方便用户鉴定代谢物,数据主要来自日本,包含代谢物质谱信息。
四、KEGG
收录生物代谢物的代谢途径,支持对代谢网络的搜寻及代谢途径的映射,包含KEGG PATHWAY、KEGG DISEASA、KEGG COMPOUND等模块。
五、LIPID MAPS
收录生物相关脂质结构和注释,包含超过40000个脂质结构,是世界上最大的公共脂质数据库,脂质分为八个类别,下一级分类。
六、Golm Metabolome Database
收录GC-MS平台代谢物分析信息,条目依据质谱图和保留时间指数分类。
七、SYS-TOMONAS
提供系统生物学方法研究假单胞菌的生物信息学平台,包含转录组、蛋白组、代谢组和代谢重构信息。
八、BiGG
基因组及代谢网络重建的知识库,集成70多个基因组级代谢网络,包含7339个代谢物,基因映射到NCBI注释,代谢产物链接到多个外部数据库。
九、MONA
自动管理存储库,高效存储和查询质谱记录,包含实验质谱和计算质谱,内含20多万图谱。
十、LipidSearch
Thermo Scientific LipidSearch软件,用于从LC-MS数据识别和相对定量细胞脂质,功能包括与系统兼容、脂质数据库、识别算法等。
十一、BioSilico
整合各类代谢数据库的网络平台,包括LIGAND、ENZYME、EcoCyyc和MetaCyc。
十二、Lipid Library
AOCS脂质库,为学生、技术人员、科学家提供脂质科学和技术在线信息来源。
十三、NuGO
营养代谢组学数据库,收录人类营养代谢组学研究中使用的小分子物质。
十四、MetaCyc
实验数据库,阐明生命各领域的代谢途径,包含3009种生物体的2722个途径,目标是分类代谢领域。
‘贰’ 中国国家学生体质健康标准数据库的介绍
中国国家学生体质健康标准数据库(China National Student Health & Fitness Database,CNSHFD)是教育部为配合推广《国家学生体质健康标准》的需要,于2004年开始建设的大型全国性学生体质健康测试数据的信息系统。数据来源于每年各级各类学校向教育部上报的学生体质健康标准测试结果。