java调用r的脚本
⑴ java通过Rserve调用R函数来生成图形的方法
你一定要用java吗？如果做一个web应用的话可以试一下shiny
http://www.rstudio.com/shiny/
⑵ 可以被java调用的脚本语言
python 语言。
python为脚本语言，易学。与各种语言的融合性较好，被称作胶水语言。同时，目前该语言的使用量稳步上升至次于java，c++，c的第四位。此外，着名的自由软件作者Eric Raymond在他的文章《如何成为一名黑客》中，将Python列为黑客应当学习的四种编程语言之一。
你可以参考：http://ke..com/view/21087.htm
取得更详细介绍。
⑶ linux环境下，java怎么调用R语言
1、下载wgethttp://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz2、解压：tar-zxvfR-3.0.1.tar.gzcdR-3.0.13、安装(当然也可以跳过)yuminstallreadline-develyuminstalllibXt-devel./configure4、配置环境并编译安装#如果使用rJava需要加上--enable-R-shlib(这个我不需要，所以加入到后面)#如果3没安装,那么后面加上：--with-readline=no--with-x=no./configure--prefix=/usr/R-3.0.1make$$makeinstall5、配置环境变量并生效vi.bash_profileexportR_HOME=/usr/R-3.0.1exportPATH=.:$R_HOME/bin:$PATH#试环境变量生效source.bash_profile6、命令行测试[admin@JDsoftware]$RWARNING:ignoringenvironmentvalueofR_HOMERversion3.0.1(2013-05-16)--"GoodSport"Copyright(C):x86_64-unknown-linux-gnu(64-bit)R是自由软件，不带任何担保。在某些条件下你可以将其自由散布。用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.用'contributors()'来看合作者的详细情况用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。用'demo()'来看一些示范程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。用'q()'退出R.>q()7、创建脚本测试(t.R)cd/opt/script/Rvimt.R#!/path/to/Rscript#第一行x<-c(1,2,3)#R语言代码y<-c(102,299,301)model<-lm(y~x)summary(model)8、测试：执行脚本RCMDBATCH--args/opt/script/R/t.Rmore/opt/script/R/t.Rout#查看执行的结果或者第二种方式Rscript/opt/script/R/test.R#结果直接输出到终端
⑷ JAVA怎么把值传递给R语言的脚本里面
何写R语言脚本 method 依 依.创建file.R文件 贰.文件首行 #!/path/to/Rscript 三.面行键入R代码 四.保存（png（）jpeg（）等函数代码定要dev.off()） 5.file.R工作目录终端输入命令 R CMD BATCH --args file.R method 贰 依.创建R脚本 贰.文件首行 #!/usr/bin/env Rscript 三.终端输入命令 R CMD BATCH --args file.R 或者 Rscript file.R chmod 漆55 file.R ./file.R method 三 依.file.sh文件键入： #!/bin/sh R --slave [other option]<file.sh method 四 归R环境 >source("/homeR/file.R"
⑸ 怎么通过java去调用并执行shell脚本以及问题总结
对于第一个问题：java抓取，并且把结果打包。那么比较直接的做法就是，java接收各种消息（db，metaq等等），然后借助于jstorm集群进行调度和抓取。
最后把抓取的结果保存到一个文件中，并且通过调用shell打包， 回传。 也许有同学会问，
为什么不直接把java调用odps直接保存文件，答案是，我们的集群不是hz集群，直接上传odps速度很有问题，因此先打包比较合适。（这里不纠结设计了，我们回到正题）
java调用shell的方法
通过ProcessBuilder进行调度
这种方法比较直观，而且参数的设置也比较方便， 比如我在实践中的代码(我隐藏了部分业务代码)：
ProcessBuilderpb = new ProcessBuilder("./" + RUNNING_SHELL_FILE, param1,
param2, param3);
pb.directory(new File(SHELL_FILE_DIR));
int runningStatus = 0;
String s = null;
try {
Process p = pb.start();
try {
runningStatus = p.waitFor();
} catch (InterruptedException e) {
}
} catch (IOException e) {
}
if (runningStatus != 0) {
}
return;
这里有必要解释一下几个参数：
RUNNING_SHELL_FILE：要运行的脚本
SHELL_FILE_DIR：要运行的脚本所在的目录； 当然你也可以把要运行的脚本写成全路径。
runningStatus：运行状态，0标识正常。 详细可以看java文档。
param1, param2, param3：可以在RUNNING_SHELL_FILE脚本中直接通过1,2,$3分别拿到的参数。
直接通过系统Runtime执行shell
这个方法比较暴力，也比较常用， 代码如下：
p = Runtime.getRuntime().exec(SHELL_FILE_DIR + RUNNING_SHELL_FILE + " "+param1+" "+param2+" "+param3);
p.waitFor();
我们发现，通过Runtime的方式并没有builder那么方便，特别是参数方面，必须自己加空格分开，因为exec会把整个字符串作为shell运行。
可能存在的问题以及解决方法
如果你觉得通过上面就能满足你的需求，那么可能是要碰壁了。你会遇到以下情况。
没权限运行
这个情况我们团队的朱东方就遇到了， 在做DTS迁移的过程中，要执行包里面的shell脚本， 解压出来了之后，发现执行不了。 那么就按照上面的方法授权吧
java进行一直等待shell返回
这个问题估计更加经常遇到。 原因是， shell脚本中有echo或者print输出， 导致缓冲区被用完了! 为了避免这种情况， 一定要把缓冲区读一下， 好处就是，可以对shell的具体运行状态进行log出来。 比如上面我的例子中我会变成：
ProcessBuilderpb = new ProcessBuilder("./" + RUNNING_SHELL_FILE, keyword.trim(),
taskId.toString(), fileName);
pb.directory(new File(CASPERJS_FILE_DIR));
int runningStatus = 0;
String s = null;
try {
Process p = pb.start();
BufferedReaderstdInput = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getInputStream()));
BufferedReaderstdError = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getErrorStream()));
while ((s = stdInput.readLine()) != null) {
LOG.error(s);
}
while ((s = stdError.readLine()) != null) {
LOG.error(s);
}
try {
runningStatus = p.waitFor();
} catch (InterruptedException e) {
}
记得在start()之后， waitFor（）之前把缓冲区读出来打log， 就可以看到你的shell为什么会没有按照预期运行。 这个还有一个好处是，可以读shell里面输出的结果， 方便java代码进一步操作。
也许你还会遇到这个问题，明明手工可以运行的命令，java调用的shell中某一些命令居然不能执行，报错：命令不存在！
比如我在使用casperjs的时候，手工去执行shell明明是可以执行的，但是java调用的时候，发现总是出错。
通过读取缓冲区就能发现错误日志了。 我发现即便自己把安装的casperjs的bin已经加入了path中（/etc/profile,
各种bashrc中）还不够。 比如：
exportNODE_HOME="/home/admin/node"
exportCASPERJS_HOME="/home/admin/casperjs"
exportPHANTOMJS_HOME="/home/admin/phantomjs"
exportPATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin:/root/bin:$NODE_HOME/bin:$CASPERJS_HOME/bin:$PHANTOMJS_HOME/bin
原来是因为java在调用shell的时候，默认用的是系统的/bin/下的指令。特别是你用root权限运行的时候。 这时候，你要在/bin下加软链了。针对我上面的例子，就要在/bin下加软链：
ln -s /home/admin/casperjs/bin/casperjscasperjs;
ln -s /home/admin/node/bin/nodenode;
ln -s /home/admin/phantomjs/bin/phantomjsphantomjs;
这样，问题就可以解决了。
如果是通过java调用shell进行打包，那么要注意路径的问题了
因为shell里面tar的压缩和解压可不能直接写：
tar -zcf /home/admin/data/result.tar.gz /home/admin/data/result
直接给你报错，因为tar的压缩源必须到路径下面， 因此可以写成
tar -zcf /home/admin/data/result.tar.gz -C /home/admin/data/ result
如果我的shell是在jar包中怎么办？
答案是：解压出来。再按照上面指示进行操作。（1）找到路径
String jarPath = findClassJarPath(ClassLoaderUtil.class);
JarFiletopLevelJarFile = null;
try {
topLevelJarFile = new JarFile(jarPath);
Enumeration<JarEntry> entries = topLevelJarFile.entries();
while (entries.hasMoreElements()) {
JarEntryentry = entries.nextElement();
if (!entry.isDirectory() entry.getName().endsWith(".sh")) {
对你的shell文件进行处理
}
}
对文件处理的方法就简单了，直接touch一个临时文件，然后把数据流写入，代码：
FileUtils.touch(tempjline);
tempjline.deleteOnExit();
FileOutputStreamfos = new FileOutputStream(tempjline);
IOUtils.(ClassLoaderUtil.class.getResourceAsStream(r), fos);
fos.close();