minicondapython
Ⅰ miniconda包含python嗎
樓上給攜廳仿的鏈接沒問題,但是 miniconda 安裝包 本身辯纖伏襲是包含 Python 的。官方原話:These Miniconda installers contain the conda package manager and Python.
Ⅱ 蘋果系統安裝了miniconda但打不開Python該怎麼辦嗎
你好肢前如果蘋果系統安裝了miniconda但打不開Python,那是軟體和系統有沖突,目前版本還沒修復這個bug,你可以等到下次版本更運激新以後旁飢襪再下載使用
Ⅲ 如何在anaconda3安裝python2
前言
Anaconda是一個Python的科學計算發行版,包含了超過300個流行的用於科學、數學、工程和數據分析的Python Packages。由於Python有2和3兩個版本,因此Anaconda也在Python2和Python3的基礎上推出了兩個發行版,即Anaconda2和Anaconda3。
有時候我們會在電腦上同時使用Anaconda2和Anaconda3兩個版本,因此有必要考慮它們的共存問題。一般的使用場景是以其中一個版本為主,另外一個版本為輔,因此只需要達到能方便的切換到備用版本,且備用版本的pip等命令能正常使用即可。
由於Anaconda2和Anaconda3包含較多的模塊,很多人是不需要這些的,因此若只想要較為純凈的Python2和Python3共存的,可以看本文最後一部分。
操作步驟
首先安裝主版本,在這里我們選擇Anaconda2,按照正常步驟安裝即可,這里假定安裝目錄為D:Anaconda2。
純凈Python共存
說是純凈,其實也不完全「純凈」,這里需要用到另外一個發行版miniconda,它僅包含Python本身和Conda包管理器,因此體積不大。使用miniconda時的共存安裝方法與上述步驟完全一致,就不贅述了。
miniconda下載主頁
總結
本文的共存實現方法其實是基於conda的創建虛擬環境的功能,詳情可見此鏈接。
因此在首先安裝主要版本之後,也可使用conda create -n py3 python=3命令來安裝Python3,但由於網路問題,這種方法容易失敗,所以自己先下載好完整安裝包,然後安裝到主版本主目錄下的envs文件夾更方便。
有人也許會說直接同時安裝Anaconda2和Anaconda3,然後將Anaconda3目錄下的python.exe改為python3.exe也可實現類似的共存。但這種方法存在一個較大的缺陷,即Anaconda3內包含的某些IDE會工作不消敗正常,如Jupyter Notebook和Spyder等,因為他們依賴於安裝目錄下的python.exe,拿枯顫且備用版本的pip等命令也沒辦法直接使用,總體來說很不方便。
Ⅳ anaconda與python什麼關系
anaconda當中包括了python。
1、Anaconda:
Anaconda指的是一個開源的Python發行版本,其包含了conda、Python等180多個科學包及其依賴項。因為包含了大量的科學包,Anaconda 的下載文件比較大,如果只需要某些包,或者需要節省帶寬或存儲空間,也可以使用握宏Miniconda這個較小的發行版。
2、Python:
Python是一種跨平台的計算機程序設計語言。 是一個高層次的結合了解釋性、編譯性、互動性和面向對象的腳本語言。最初被設計用於編寫自動化腳本,隨著版本的不斷更新和語言新功能的添加,越多被用於獨立的、大型項目的開發。
(4)minicondapython擴展閱讀:
Python的設計哲學是「優雅」、「明確」、「簡單」。因此,Perl語言中「總是有飢慧多種方法來做同一件事」的理念在Python開發者中通常是難以忍受的。
Python開發者的哲學是「用一種方法,最好是只有一種方法來做一件事」。在設計Python語言時,如果面臨多種選擇,Python開發者一般會拒絕花俏的語法,而選擇明確的沒有或者很少有歧義的語法。
由於這種設計觀念的差異爛皮答,Python源代碼通常被認為比Perl具備更好的可讀性,並且能夠支撐大規模的軟體開發。這些准則被稱為Python格言。在Python解釋器內運行import this可以獲得完整的列表。
Ⅳ Miniconda使用體驗
生信入門的第一步就是要學會安裝軟體,但有些軟體的安裝和編譯比較麻煩,這個時候就會懷念windows系統的方便。
根據生信技能樹和菜鳥團里的介紹,linux系統也有這種自動式的安裝軟體的方式,因此,開始體驗使用conda來安裝軟體。
安裝簡單,只需要在伺服器上運行即可
此時會在home目錄下生成miniconda3的文件夾,並更新下環境變數。
註:如果安裝後不想在終端前顯示(base)
conda install fastqc(軟體名)
which fastqc 查看軟體安裝位置
conda list 可以查看已安盯裂裝軟體列表,conda默認安裝軟體的最新版本,如果想安裝指定版本的某個軟體,可以先用「conda search 軟體名」搜索軟體版本。
星號標記的表示是已經安裝的版本。要 安裝其他版本 ,輸入:
conda install 軟體名=版本號
這時conda會先卸載已安裝版本,然後重新安裝指定版本。
如果想要安裝列表中的軟體,可進入該軟體的conda主頁,比如cutadapt[ https://anaconda.org/bioconda/cutadapt ]
裡面會告訴應該使用什麼命令~
安裝完後的軟體在miniconda2文件肆差夾裡面的pkgs文件夾下面。
conda config --add channels
查看已經添加的channels
conda config --get channels
conda config --remove channels
conda update conda
conda remove 軟體名
source activate 軟體名 #把目錄添加進環境變數
source deactivate #從環境變數裡面 刪去
conda info -e
例子:
安裝snakemake,snakemake已經整理成Python包,可以直接使用 pip 進行安裝,不過需要的Python3的環境,利用 conda 進行安裝:
試試 snakemake -h 看看安裝成功沒有?
但是可能網路會不太好,可能需要多幾次進行安凱雹閉裝。
參考:
用Miniconda,Bioconda來安裝常見的生物信息學軟體 | 生信菜鳥團 [ http://www.bio-info-trainee.com/1906.html] ;
http://www.biotrainee.com/thread-838-1-1.html 。
Ⅵ miniconda2可以裝python3
可以。miniconda2是一唯純款目前最流行的環境管理工具,python3是一個高層次的結合了解釋性、編譯性、褲判互動性和面向對象的腳本語言。miniconda2可以裝python3,功指純咐能性強大,可以進行程序編寫,性價比高。
Ⅶ 電腦上新下載了python3.8,如何將jupyter的內核切換為這個新安裝的3.8版本
切換jupyter的內核是不行的,因為jupyter雖然是個集成環境,但是它同時是python的一個包中的組成部分,所以只能在python3.8中另外下載安裝notebook了;
因為,對應本題,jupyter所在的包notebook是安裝在python舊版本的,不一定與python3.8新版本相兼容。
在python3.8中安裝notebook的操作方法,如下:
打開你的python3.8環境(比如miniconda環境,或者自己手工配置環境變數),檢查一下,運行以下兩個命令之一然後exit()
python
python3
看一下版本是3.x
確認是3.8版本之後,
pip install notebook
或者
pip3 install notebook
然後就可以在新環境中使用jupyter notebook了
Ⅷ anaconda怎麼運行python代碼
輸入相應Python代碼。
首先在電腦中、搜索、anaconda、飢燃navigator,進入程序主界面,找到、spyder、,點擊底部的、launch、,按功能鍵F5即可運行Python程序。或宴肢余者可以在開始菜單中搜索、anaconda、prompt、,輸入相應Python代碼,即可運行。
Anaconda、實際上是一個軟體發行版,它附帶了、conda、Python、和、150、多個科學包及其依賴項。應晌滾用程序、conda、是包和環境管理器。Anaconda、的下載文件比較大(約、500、MB),因為它附帶了、Python、中最常用的數據科學包。如果只需要某些包,或者需要節省帶寬或存儲空間,也可以使用、Miniconda、這個較小的發行版(僅包含、conda、和、Python)。、
Ⅸ 如何用anaconda python
序
Python易用,但用好卻不易,其中比較頭疼的就是包管理和Python不同版本的問題,特別是當你使用Windows的時候。為了解決這些問題,有不少發行版的Python,比如WinPython、Anaconda等,這些發行版將python和許多常用的package打包,方便pythoners直接使用,此外,還有virtualenv、pyenv等工具管理虛擬環境。
個人嘗試了很多類似的發行版,最終選擇了Anaconda,因為其強大而方便的包管理與環境管理的功能。該文主要介紹下Anaconda,對Anaconda的理解,並簡要總結下相關的操作。
Anaconda概述
Anaconda是一個用於科學計算的Python發行版,支持 Linux, Mac, Windows系統,提供了包管理與環境管理的功能,可以很方便地解決多版本python並存、切換以及各種第三方包安裝問題。Anaconda利用工具/命令conda來進行package和environment的管理,並且已經包含了Python和相關的配套工具。
這里先解釋下conda、anaconda這些概念的差別。conda可以理解為一個工具,也是一個可執行命令,其核心功能是包管理與環境管理。包管理與pip的使用類似,環境管理則允許用戶方便地安裝不同版本的python並可以快速切換。Anaconda則是一個打包的集合,裡面預裝好了conda、某個版本的python、眾多packages、科學計算工具等等,所以也稱為Python的一種發行版。其實還有Miniconda,顧名思義,它只包含最基本的內容——python與conda,以及相關的必須依賴項,對於空間要求嚴格的用戶,Miniconda是一種選擇。
進入下文之前,說明一下conda的設計理念——conda將幾乎所有的工具、第三方包都當做package對待,甚至包括python和conda自身!因此,conda打破了包管理與環境管理的約束,能非常方便地安裝各種版本python、各種package並方便地切換。
Anaconda的安裝
Anaconda的下載頁參見官網下載,Linux、Mac、Windows均支持。
安裝時,會發現有兩個不同版本的Anaconda,分別對應Python 2.7和Python 3.5,兩個版本其實除了這點區別外其他都一樣。後面我們會看到,安裝哪個版本並不本質,因為通過環境管理,我們可以很方便地切換運行時的Python版本。(由於我常用的Python是2.7和3.4,因此傾向於直接安裝Python 2.7對應的Anaconda)
下載後直接按照說明安裝即可。這里想提醒一點:盡量按照Anaconda默認的行為安裝——不使用root許可權,僅為個人安裝,安裝目錄設置在個人主目錄下(Windows就無所謂了)。這樣的好處是,同一台機器上的不同用戶完全可以安裝、配置自己的Anaconda,不會互相影響。
對於Mac、Linux系統,Anaconda安裝好後,實際上就是在主目錄下多了個文件夾(~/anaconda)而已,Windows會寫入注冊表。安裝時,安裝程序會把bin目錄加入PATH(Linux/Mac寫入~/.bashrc,Windows添加到系統變數PATH),這些操作也完全可以自己完成。以Linux/Mac為例,安裝完成後設置PATH的操作是
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# 將anaconda的bin目錄加入PATH,根據版本不同,也可能是~/anaconda3/bin
echo 'export PATH="~/anaconda2/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
# 更新bashrc以立即生效
source ~/.bashrc
配置好PATH後,可以通過which conda或conda --version命令檢查是否正確。假如安裝的是Python 2.7對應的版本,運行python --version或python -V可以得到Python 2.7.12 :: Anaconda 4.1.1 (64-bit),也說明該發行版默認的環境是Python 2.7。
Conda的環境管理
Conda的環境管理功能允許我們同時安裝若干不同版本的Python,並能自由切換。對於上述安裝過程,假設我們採用的是Python 2.7對應的安裝包,那麼Python 2.7就是默認的環境(默認名字是root,注意這個root不是超級管理員的意思)。
假設我們需要安裝Python 3.4,此時,我們需要做的操作如下:
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# 創建一個名為python34的環境,指定Python版本是3.4(不用管是3.4.x,conda會為我們自動尋找3.4.x中的最新版本)
conda create --name python34 python=3.4
# 安裝好後,使用activate激活某個環境
activate python34 # for Windows
source activate python34 # for Linux & Mac
# 激活後,會發現terminal輸入的地方多了python34的字樣,實際上,此時系統做的事情就是把默認2.7環境從PATH中去除,再把3.4對應的命令加入PATH
# 此時,再次輸入
python --version
# 可以得到`Python 3.4.5 :: Anaconda 4.1.1 (64-bit)`,即系統已經切換到了3.4的環境
# 如果想返回默認的python 2.7環境,運行
deactivate python34 # for Windows
source deactivate python34 # for Linux & Mac
# 刪除一個已有的環境
conda remove --name python34 --all
用戶安裝的不同python環境都會被放在目錄~/anaconda/envs下,可以在命令中運行conda info -e查看已安裝的環境,當前被激活的環境會顯示有一個星號或者括弧。
說明:有些用戶可能經常使用python 3.4環境,因此直接把~/anaconda/envs/python34下面的bin或者Scripts加入PATH,去除anaconda對應的那個bin目錄。這個辦法,怎麼說呢,也是可以的,但總覺得不是那麼elegant……
如果直接按上面說的這么改PATH,你會發現conda命令又找不到了(當然找不到啦,因為conda在~/anaconda/bin里呢),這時候怎麼辦呢?方法有二:1. 顯式地給出conda的絕對地址 2. 在python34環境中也安裝conda工具(推薦)。
Conda的包管理
Conda的包管理就比較好理解了,這部分功能與pip類似。
例如,如果需要安裝scipy:
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# 安裝scipy
conda install scipy
# conda會從從遠程搜索scipy的相關信息和依賴項目,對於python 3.4,conda會同時安裝numpy和mkl(運算加速的庫)
# 查看已經安裝的packages
conda list
# 最新版的conda是從site-packages文件夾中搜索已經安裝的包,不依賴於pip,因此可以顯示出通過各種方式安裝的包
conda的一些常用操作如下:
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# 查看當前環境下已安裝的包
conda list
# 查看某個指定環境的已安裝包
conda list -n python34
# 查找package信息
conda search numpy
# 安裝package
conda install -n python34 numpy
# 如果不用-n指定環境名稱,則被安裝在當前活躍環境
# 也可以通過-c指定通過某個channel安裝
# 更新package
conda update -n python34 numpy
# 刪除package
conda remove -n python34 numpy
前面已經提到,conda將conda、python等都視為package,因此,完全可以使用conda來管理conda和python的版本,例如
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# 更新conda,保持conda最新
conda update conda
# 更新anaconda
conda update anaconda
# 更新python
conda update python
# 假設當前環境是python 3.4, conda會將python升級為3.4.x系列的當前最新版本
補充:如果創建新的python環境,比如3.4,運行conda create -n python34 python=3.4之後,conda僅安裝python 3.4相關的必須項,如python, pip等,如果希望該環境像默認環境那樣,安裝anaconda集合包,只需要:
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# 在當前環境下安裝anaconda包集合
conda install anaconda
# 結合創建環境的命令,以上操作可以合並為
conda create -n python34 python=3.4 anaconda
# 也可以不用全部安裝,根據需求安裝自己需要的package即可
設置國內鏡像
如果需要安裝很多packages,你會發現conda下載的速度經常很慢,因為Anaconda.org的伺服器在國外。所幸的是,清華TUNA鏡像源有Anaconda倉庫的鏡像,我們將其加入conda的配置即可:
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# 添加Anaconda的TUNA鏡像
conda config --add channels u.cn/anaconda/pkgs/free/
# TUNA的help中鏡像地址加有引號,需要去掉
# 設置搜索時顯示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes
執行完上述命令後,會生成~/.condarc(Linux/Mac)或C:UsersUSER_NAME.condarc文件,記錄著我們對conda的配置,直接手動創建、編輯該文件是相同的效果。
跋
Anaconda具有跨平台、包管理、環境管理的特點,因此很適合快速在新的機器上部署Python環境。總結而言,整套安裝、配置流程如下:
下載Anaconda、安裝
配置PATH(bashrc或環境變數),更改TUNA鏡像源
創建所需的不用版本的python環境
Just Try!
Ⅹ miniconda和python
你可以在你的python腳本裡面直接import這個腳本,這樣的話就不需要安裝了。