細胞資料庫
發布時間: 2023-02-09 00:51:59
① deepcell使用的什麼演算法
使用DeepMACT演算法。
Deepcell利用人工智慧技術根據細胞形態差異實現高精度、可重復、無偏差的鑒定和分類,同時保持細胞活力。 迄今為止,Deepcell的人工智慧分類器已經訓練了數千萬張多種類型的細胞圖像,作為該公司快速增長的細胞形態學圖譜的一部分, 它能夠准確地區分各種免疫細胞亞型、各種癌症細胞和基質細胞。
該系統的基本原理是一個專有的微流體台式儀器,它允許在線細胞成像,以監督和非監督分類和排序,目前已發展為存有10億細胞圖像信息的資料庫,基於如此龐大的數據集,研究人員可以在不同的層面進行深度挖掘。
② 如何利用資料庫查詢細胞某基因表達情況
一個良好的開端就是分析感興趣基因的突變和其它異常,ICGC數據門戶提供了幾條研究路線。輸入一個基因名稱,NCBI登錄號,或者Ensembl基因ID,點擊基因報告(Gene Report),就能在突變摘要(Mutation Summary)中找到已發現的突變和拷貝數變化,以及迄今為止,這些突變在腫瘤中出現的頻率。COSMICsection就在體細胞突變列表下方,包括了點突變,少量缺失,以及插入突變等方面的數據。
③ 怎樣查到一個特定細胞株的相關知識和培養條件
ATCC (American Type Culture Collection) 收集了絕大多數細胞的詳細資料。資料庫中有每一種細胞的詳細描述,包括細胞的來源,培養和凍存條件,以及相關文獻等資料。
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