rfam資料庫
① 高通量測序數據公共資料庫有哪些
我原來常用的：
NCBI：持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻資料庫，Taxonomy數據，COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫，BLAST的單機程序，以及各種工具程序。
EBI：和NCBI類似，歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具，比如多序列比對。
Uniprot：全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分：SwissProt是人工校對過的，TrEMBL是自動校對的。
Pfam：蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西，而且找到的東西是結構域。
Rfam：RNA的，類似Pfam。
② 求助鐵路財務會計管理信息系統怎麼在win 7上安裝啊
鐵路財務會計管理信息系統客戶端在win 7上安裝：
1.檢查 Microsoft .NET Framework 組件版本在4.0及以下，現在默認安裝該組件都 是4.5及以上，因為4.5以上鐵路財務核算軟體不支持，所以目前只選擇4.0或3.5版本；否則財務軟體無法安裝使用，最好是選擇組件是4.0的win7系統安裝，也可以在程序管理中卸載4.5，在網上下載一個4.0或3.5的版本安裝一下。
2.將機器的防火牆和殺毒軟體全退出。
3.開始安裝財務5.0客戶端軟體，注意：改一下默認安裝路徑，改在D盤
4.設置用戶的許可權，開放對安裝路徑的完全控制許可權。
5.將 ie瀏覽器安全設置為中，（系統一般默認是中－高）。
6.增加信任站點，就是登陸的財務集中站點
7. 將視圖設置為在所有窗口中均使用兼容視圖
8.在注冊表中加上安裝該軟體的鍵值,如：
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Rfamis]
"path"="D:\\Program Files\\源越通軟體\\鐵路財務會計管理信息系統客戶端"
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Rfamis\client]
"default"="D:\\Program Files\\源越通軟體\\鐵路財務會計管理信息系統客戶端"
9.ie版本在10以下都可以，建議使用IE8
10.360瀏覽器也可以用。
僅供參考。
③ 國外與生物信息學相關的網站有哪些
國外與生物信息學相關的網站有哪些
生物信息學高度依賴於網路。實際上，你需要的幾乎所有資源，都可以從網上下到。你需要關注你研究領域所需要的那些，而不是全部的資源。
我原來常用的：
NCBI：持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻資料庫，Taxonomy數據，COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫，BLAST的單機程序，以及各種工具程序。
EBI：和NCBI類似，歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具，比如多序列比對。
Uniprot：全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分：SwissProt是人工校對過的，TrEMBL是自動校對的。
Pfam：蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西，而且找到的東西是結構域。
Rfam：RNA的，類似Pfam。
RDP：16S rRNA庫。除了序列，它還有一個基於K-mer naive Bayesian model的rdp classifier，可以對輸入序列進行物種分類，效率和准確性較直接使用BLAST更高。
GreenGenes：也是16S庫，不過它只收集比較全的序列。它提供了一個16S的標准化比對，並基於這個東西搞了個物種分類工具。
EMBOSS：一個工具包，提供了幾百個進行序列操作的工具。
BioPerl、Biopython：Perl和Python的生物學模塊。
R：類似matlab的語言，有一大堆的生物學包。
SOAP：華大基因搞的高通量測序工具包，有de-novo拼接的，有mapping的，還有一些後續分析的。
bowtie：一個用於序列mapping的軟體。
samtools：用於操縱、分析高通量序列mapping的結果。功能非常靈活，但有點復雜。
fastx toolkit：用來操縱高通量測序序列的工具包。
④ 學習生物信息學有哪些比較好的網站或論壇
生信菜鳥團上大學之後，我上網找資料時發現的第一個博客就是生信菜鳥團，裡麵包羅萬象，涵蓋很多方面（初次發現時，就感覺自己進入了新的天地）rabbit gao's blog 我超喜歡這個師兄的博客裡面的筆記，很直觀，尤其是python那部分。他是以代碼的形式展示內容。沈夢圓博客夢圓師姐，和我一樣喜歡用熊貓頭像，她的博客也是剛剛建立不長時間。師姐的文筆很贊，看裡面博文相信對你有幫助的。生信日誌|鳴一道鳴一道師兄的博客我比較喜歡的是R做圖那一塊plob這個我比較少看，不過內容也不錯，我後續再寫上這個博客的描述。陳連福博客聽說連福老師有開培訓班，實力自然也不差。糗世界←歡迎來到糗糗的世界糗世界主要包括：序列比對與NGS R/bioconctorcircos教程，其中糗世界關於R和bioconctor以及NGS的歸納總結特別詳盡生信客部落生信客部落是我自己的博客，剛建不久（2016.9.3建的），我目前在准備考研，打理的時間不多。但相信是一隻潛力股，有提升的空間。也歡迎博友們交換 "友情鏈接".hope博客 hope 他（她）有一篇關於生物信息學在線工具的總結，我特別喜歡科研動力「endnote使用寶典」，專注寫endnote相關的內容。（註：endnote 是文獻管理的軟體，插入引用文獻的神器）biochen生物伯臣生物里也蠻多歸納整理的Bob's Blog bob這位兄弟的博客我接觸不多，我後續補上描述.論壇（包括生信論壇和其他一些相關的網站）：生信技能樹生信技能樹前面那個師兄有詳細描述過。我也親眼見證了它從無到有的過程，看著生信技能樹感覺特別親切，感覺就像自家的孩子一樣。我自己由於准備考研和書寫畢業論文的事情，在生信技能樹建設的參與度不高。總之，好喜歡......生物信息學天空內容超全的一個生信論壇丁香園（生信板塊）丁香園，就不解釋了，一個國內最成功的論壇之一。醫學生基本都知道的一個論壇。小木蟲小木蟲，裡面蠻多資源的，也是國內最成功的論壇之一生物統計家園描述待輸入...基因堂描述待輸入biostars這是一個生信問答網站生信刷題網站ROSALIND | About 這個是一個生物信息的刷題網站，超多實戰題（純英文，既提高英語水平，又訓練了自己的實戰能力，何樂而不為）。實戰走起......生物信息學在線工具網站生信客部落生物信息工具整合(包含在線工具與離線工具)–更新中這裡麵包含了一些生物信息學可視化工具，包含在線的工具和一些離線的可視化工具，由於目前個人水平有限，所以還有待繼續完善
⑤ 蛋白質資料庫的內容
Protein Sequence Databases: Antibodies: Sequence and Structure
BRENDA: Enzyme database
CD Antigens: Database of CD antigens
dbCFC: Cytokine family database
Histons: Histone sequence database
HPRD: Human protein reference database
InterPro: Intergrated documentation 5resources for protein families
iProClass: An integrated protein classification database
KIND: A non-rendant protein sequence database
MHCPEP: Database of MHC binding peptides
MIPS: Munich information centre for protein sequences
PIR: Annotated, and non-rendant protein sequence database
PIR-ALN: Curated database of protein sequence alignments
PIR-NREF: PIR nonrendent reference protein database
PMD: Protein mutant database
PRF: Protein research foundation, Japan
ProClass: Non-rendant protein database
ProtoMap: Hierarchical classification of swissprot proteins
REBASE: Restriction enzyme database
RefSeq: Reference sequence database at NCBI
SwissProt: Curated protein sequence database
SPTR: Comprehensive protein sequence database
Transfac: Transcription factor database
TrEMBL: Annotated translations of EMBL nucleotide sequences
Tumor gene database: Genes with cancer-causing mutations
WD repeats: WD-repeat family of proteins Protein Structure Databases: Cath: Protein structure classification
HIV Protease: HIV protease database 3D structure
PDB: 3-D macromolecular structure data
PSI: Protein structure initiative
S2F: Structure to function project
Scop: Structural Classification of Proteins Protein Domains, Motifs & Signatures: BLOCKS: Multipe aligned segments of conserved protein regions
CCD: Conserved domain database and search service
DOMO: Homologous protein domain families
Pfam: Database of protein domains and HMMs
ProDom: Protein domain database
Prints: Protein motif fingerprint database
Prosite: Database of protein families and domains
SMART: Simple molar architecture research tool
TIGRFAM: Protein families based on HMMs Others: Phospho Site: Database of phosphorylation sites
⑥ 在你看來學習生物信息學有哪些比較好的網站或論壇
國外與生物信息學相關的網站有哪些
生物信息學高度依賴於網路。實際上，你需要的幾乎所有資源，都可以從網上下到。你需要關注你研究領域所需要的那些，而不是全部的資源。
我原來常用的：
NCBI：持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻資料庫，Taxonomy數據，COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫，BLAST的單機程序，以及各種工具程序。
EBI：和NCBI類似，歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具，比如多序列比對。
Uniprot：全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分：SwissProt是人工校對過的，TrEMBL是自動校對的。
Pfam：蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西，而且找到的東西是結構域。
Rfam：RNA的，類似Pfam。
RDP：16S rRNA庫。除了序列，它還有一個基於K-mer naive Bayesian model的rdp classifier，可以對輸入序列進行物種分類，效率和准確性較直接使用BLAST更高。
GreenGenes：也是16S庫，不過它只收集比較全的序列。它提供了一個16S的標准化比對，並基於這個東西搞了個物種分類工具。
EMBOSS：一個工具包，提供了幾百個進行序列操作的工具。
BioPerl、BioPython：Perl和Python的生物學模塊。
R：類似matlab的語言，有一大堆的生物學包。
SOAP：華大基因搞的高通量測序工具包，有de-novo拼接的，有mapping的，還有一些後續分析的。
bowtie：一個用於序列mapping的軟體。
samtools：用於操縱、分析高通量序列mapping的結果。功能非常靈活，但有點復雜。
fastx toolkit：用來操縱高通量測序序列的工具包。
⑦ 網上的生物信息學資源都有哪些
生物信息學高度依賴於網路。實際上，你需要的幾乎所有資源，都可以從網上下到。你需要關注你研究領域所需要的那些，而不是全部的資源。
我原來常用的：
NCBI：持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻資料庫，Taxonomy數據，COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫，BLAST的單機程序，以及各種工具程序。
EBI：和NCBI類似，歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具，比如多序列比對。
Uniprot：全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分：SwissProt是人工校對過的，TrEMBL是自動校對的。
Pfam：蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西，而且找到的東西是結構域。
Rfam：RNA的，類似Pfam。
RDP：16S rRNA庫。除了序列，它還有一個基於K-mer naive Bayesian model的rdp classifier，可以對輸入序列進行物種分類，效率和准確性較直接使用BLAST更高。
GreenGenes：也是16S庫，不過它只收集比較全的序列。它提供了一個16S的標准化比對，並基於這個東西搞了個物種分類工具。
EMBOSS：一個工具包，提供了幾百個進行序列操作的工具。
BioPerl、BioPython：Perl和Python的生物學模塊。
R：類似matlab的語言，有一大堆的生物學包。
SOAP：華大基因搞的高通量測序工具包，有de-novo拼接的，有mapping的，還有一些後續分析的。
bowtie：一個用於序列mapping的軟體。
samtools：用於操縱、分析高通量序列mapping的結果。功能非常靈活，但有點復雜。
fastx toolkit：用來操縱高通量測序序列的工具包。