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linuxr語言

發布時間: 2022-09-20 01:27:40

linux環境下,java怎麼調用R語言

1、下載wgethttp://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz2、解壓:tar-zxvfR-3.0.1.tar.gzcdR-3.0.13、安裝(當然也可以跳過)yuminstallreadline-develyuminstalllibXt-devel./configure4、配置環境編譯安裝#如果使用rJava需要加上--enable-R-shlib(這個我不需要,所以加入到後面)#如果3沒安裝,那麼後面加上:--with-readline=no--with-x=no./configure--prefix=/usr/R-3.0.1make$$makeinstall5、配置環境變數並生效vi.bash_profileexportR_HOME=/usr/R-3.0.1exportPATH=.:$R_HOME/bin:$PATH#試環境變數生效source.bash_profile6、命令行測試[admin@JDsoftware]$RWARNING:ignoringenvironmentvalueofR_HOMERversion3.0.1(2013-05-16)--"GoodSport"Copyright(C):x86_64-unknown-linux-gnu(64-bit)R是自由軟體,不帶任何擔保。在某些條件下你可以將其自由散布。用'license()'或'licence()'來看散布的詳細條件。R是個合作計劃,有許多人為之做出了貢獻.用'contributors()'來看合作者的詳細情況用'citation()'會告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。用'demo()'來看一些示範程序,用'help()'來閱讀在線幫助文件,或用'help.start()'通過HTML瀏覽器來看幫助文件。用'q()'退出R.>q()7、創建腳本測試(t.R)cd/opt/script/Rvimt.R#!/path/to/Rscript#第一行x<-c(1,2,3)#R語言代碼y<-c(102,299,301)model<-lm(y~x)summary(model)8、測試:執行腳本RCMDBATCH--args/opt/script/R/t.Rmore/opt/script/R/t.Rout#查看執行的結果或者第二種方式Rscript/opt/script/R/test.R#結果直接輸出到終端

⑵ R語言是一種什麼樣的語言

R 語言,一種自由軟體編程語言與操作環境,主要用於統計分析、繪圖、數據挖掘。R 本來是由來自紐西蘭奧克蘭大學的羅斯·伊哈卡和羅伯特·傑特曼開發,現在由「R 開發核心團隊」負責開發。R 基於 S 語言的一個 GNU 計劃項目,所以也可以當作 S 語言的一種實現,通常用 S 語言編寫的代碼都可以不作修改的在 R 環境下運行。

R 語言

R 的源代碼可自由下載使用,亦有已編譯的可執行文件版本可以下載,可在多種平台下運行,包括 UNIX(也包括 FreeBSD 和 Linux)、Windows 和 MacOS。R 主要是以命令行操作,同時有人開發了幾種圖形用戶界面,其中 RStudio 是最為廣泛使用的集成開發環境。

功能

R 內置多種統計學及數字分析功能。R 的功能也可以透過安裝包(Packages,用戶撰寫的功能)增強。因為 S 的血緣,R 比其他統計學或數學專用的編程語言有更強的面向對象(面向對象程序設計, S3, S4 等)功能。

R 的另一強項是繪圖功能,制圖具有印刷的素質,也可加入數學符號。

雖然 R 主要用於統計分析或者開發統計相關的軟體,但也有人用作矩陣計算。其分析速度可媲美專用於矩陣計算的自由軟體 GNU Octave 和商業軟體 MATLAB。

⑶ linux伺服器安裝R語言及Rstudio server

在linux伺服器上使用R語言及Rstudio server
cat /etc/redhat-release: 查看伺服器系統版本

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.e.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz

checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

6.安裝
make
make install
安裝成功!

R #在命令行直接輸入「R」即可進入R 編輯。
q() ##退出R編輯
7.安裝R-studio-server
wget https://download2.rstudio.org/server/centos6/x86_64/rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm

yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm
8.R-studio-server的一些命令
rstudio-server start ##啟動 rstudio
rstudio-server stop ## 關閉rstudio
rstudio-server status ## 查看rstudio 運行狀態
運行rstudio-server status出現 「Active: active (running) 」 表示rstudio 已啟動
rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安裝錯誤
rstudio-server restart ##重啟

ifconfig ##查看伺服器ip地址。
查看運行中R進程
rstudio-server active-sessions
指定PID,停止運行中的R進程
rstudio-server suspend-session <pid>
停止所有運行中的R進程
rstudio-server suspend-all
強制停止運行中的R進程,優先順序最高,立刻執行
rstudio-server force-suspend-session <pid>
rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server臨時下線,不允許web訪問,並給用戶友好提示
rstudio-server offline
RStudio Server臨時上線
rstudio-server online

8.rstudio-server系統設置
主要有兩個配置文件,默認文件不存在(非必要,可不做修改)
/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf

vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8080#監聽埠,默認是8787,可以不做修改
www-address=127.0.0.0#允許訪問的IP地址,默認0.0.0.0

rstudio-server restart

vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30#會話超時時間
r-cran-repos= http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN資源庫
rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安裝,更改R所在目錄。
9.通過瀏覽器連接Rstudio-server
直接打開瀏覽器,輸入http://<伺服器ip>:8787 ## 如果修改過rserver.conf文件,後面的8787埠改為相應的埠即可。

這里需要我們輸入用戶名和密碼。關於用戶名有2點注意事項:
(1).不允許使用system 用戶登陸,即用戶ids小於100的用戶。只能用普通用戶登錄
(2).用戶的認證可以使用RSA。
如果沒有普通用戶,可以添加:

useradd newname # 添加一個名為newname的用戶
passwd newname ###給新用戶newname 設置密碼,密碼需是復雜密碼,否則可能通不過。
usermod -G happy newname ####將新用戶newname添加到happy 用戶組中,
在用useradd添加用戶之後,在默認的情況下,該賬號是暫時被封鎖的, 也就是說,該賬號是無法登錄,須要用passwd命令來給新創建的用戶設置密碼之後才可以使用。

10可能存在的問題
10.1如果你的rstudio-server沒有啟動 很大程度是安裝有誤,這里我將我遇到的錯誤分享出來
rstudio-server verify-installation

There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that
it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not
configure with --enable-R-shlib.
這里就提到無法找到libR.so文件,原因是配置R語言文件時,沒有加參數--enable-R-shlib.
這就必須要重新安裝R語言。使用make uninstall 刪除之前的安裝,最好也刪除R-3.6.1所在的文件夾,用「rm -r -f R-3.6.1".

使用rm 命令 -r 參數表示全部刪除, -f 參數表示強制刪除,不會提醒。 同時使用這兩個參數要小心。
10.2 普通用戶無法啟動rstudio-server
sudo rstudio-server start## 以管理員方式執行命令
這時會需要輸入密碼並提示
xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.
如果不想出現上面的提示,就是給該用戶提高許可權,添加用戶使用sudo的權利。

su root ###切換到root用戶,如果有root許可權的話。
chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的寫許可權
vi /etc/sudoers ###編輯sudoers文件,添加許可權。
找到這行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (這里的xxx是你的用戶名)

youuser ALL=(ALL) ALL
%youuser ALL=(ALL) ALL
youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL

chmod u-w /etc/sudoers ##撤銷sudoers文件寫許可權

⑷ linux虛擬系統中怎麼安裝最新版R語言

一.准備安裝所需要的軟體:

1.VMware虛擬機的下載和安裝在我的博客中已經提到,這里就不再詳細闡述。

2.下載一個redhat,因為redhat已經商業化了,推薦大家使用centos,如果自己有合適的linux安裝版本,可以不使用這個。

二.在VMware虛擬機為RedHat Linux創建新的虛擬機 :

1.打開虛擬機,選擇新建虛擬機:
2.選擇自定義(這里選擇典型可能會在安裝過程中出現一個硬體找不到的錯誤,所以推薦選擇自定義),然後點下一步:
3 作系統選擇linux,版本不用修改:
4.命名,並選擇虛擬操作系統的存放位置(位置所在硬碟空間最好大於5G):
5.給虛擬機分配內存(這個自己看情況,我的電腦內存是512,給虛擬機分配了256)
6.選擇虛擬機網路類型(推薦使用橋接網路)
7.選擇磁碟類型,這里選擇IDE(這也是第三步選擇自定義的原因,因為選擇典型的話,系統會自動選擇SCSI硬碟,而有的linux,主要是早的linux版本,不能使用SCSI硬碟,所以才會出現沒有發現硬碟的錯誤)
8.指定磁碟容量(推薦大小為8g,基本夠用了)
二、安裝linux系統就很簡單了,網上也有很多的教程。虛擬機和真實伺服器基本么有什麼差別。
三、linux下安裝程序
1.yum 安裝 直接敲yum install 後面跟軟體名稱,linux系統會自動到yum源上尋找你所要安裝的軟體,以及它所需要的依賴關系的軟體等
2.rpm安裝 也是直接敲rpm install後面跟軟體名稱,系統會到rpm源上尋找軟體,但是可能會提示在安裝它之前還需要安裝其他的軟體,yum會直接幫你安裝,但是rpm不會,你需要自己安裝
3.源碼包安裝 相對於yum和rpm安裝。源碼包安裝比較麻煩,但是它相當於軟體的定製版,你可以設定安裝目錄及安裝參數等等,比較自由。

⑸ Linux與R語言的關系

2、解壓:
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安裝 (當然也可以跳過)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、 配置環境並編譯安裝
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(這個我不需要,所以加入到後面)
# 如果3沒安裝, 那麼後面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install

5、配置環境變數並生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 試環境變數生效
source .bash_profile

6、 命令行測試
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由軟體,不帶任何擔保。
在某些條件下你可以將其自由散布。
用'license()'或'licence()'來看散布的詳細條件。

R是個合作計劃,有許多人為之做出了貢獻.
用'contributors()'來看合作者的詳細情況
用'citation()'會告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。

用'demo()'來看一些示範程序,用'help()'來閱讀在線幫助文件,或
用'help.start()'通過HTML瀏覽器來看幫助文件。
用'q()'退出R.

> q()

7、創建腳本測試(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R

#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R語言代碼
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)

8、測試:執行腳本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看執行的結果
或者第二種方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#結果直接輸出到終端

⑹ linux伺服器怎麼運行r語言

我有點不太理解是什麼意思……Linux系統都有對應的R軟體版本,可以從R的官網下載,安裝了之後直接打開R運行就好了吧。

⑺ 跪求!!Linux下用R語言畫圖的高手(Error in X11,unable to open connection to X11 display )

樓主圖形界面是必須在X模式下顯示的,就算你需要瀏覽一張圖片也需要X。
除非你這個圖片單純由printf colour組成的。

if [ -n "$(pgrep -x X) ]; then
sudo killall X
fi
xinit &> /dev/null &
export DISPLAY=:0.0

你可以去問下你們老師,他絕對不敢說,比如說我打開office不需要啟動X

⑻ 如何在linux環境下使用r語言

1、下載
wget http://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

2、解壓:
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安裝 (當然也可以跳過)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、 配置環境並編譯安裝
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(這個我不需要,所以加入到後面)
# 如果3沒安裝, 那麼後面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install

5、配置環境變數並生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 試環境變數生效
source .bash_profile

6、 命令行測試
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由軟體,不帶任何擔保。
在某些條件下你可以將其自由散布。
用'license()'或'licence()'來看散布的詳細條件。

R是個合作計劃,有許多人為之做出了貢獻.
用'contributors()'來看合作者的詳細情況
用'citation()'會告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。

用'demo()'來看一些示範程序,用'help()'來閱讀在線幫助文件,或
用'help.start()'通過HTML瀏覽器來看幫助文件。
用'q()'退出R.

> q()

7、創建腳本測試(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R

#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R語言代碼
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)

8、測試:執行腳本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看執行的結果
或者第二種方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#結果直接輸出到終端

⑼ linux r語言寫的包怎麼使用

1、通過選擇菜單:程序包->安裝程序包->在彈出的對話框中,選擇你要安裝的包,然後確定。2、使用命令install.packages(package_name,dir)package_name:是指定要安裝的包名,請注意大小寫。dir:包安裝的路徑。默認情況下是安裝在..\library 文件...

⑽ linux R語言運行腳本,提示載入程輯包,運行不成功

「載入需要的程輯包:」這種提示沒什麼大不了的,實在覺得煩就在腳本里導致出現這些東西的命令外面套一層suppressMessages()函數,比如suppressMessages(library(foreach))。
關鍵是後面提示的錯誤要解決。

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