癌症資料庫

⑴ 臨床數據需要共享+可以放在哪些公共資料庫

摘要 美國國家癌症資料庫(National Cancer Database, NCDB)是經國家認證的，由美國外科醫師學會和美國癌症學會聯合組建的，它是一個基於醫院登記數據的臨床腫瘤學資料庫，來源於超過1500多個癌症委員會認證的機構。NCDB資料庫可用於分析和跟蹤惡性腫瘤患者的治療過程和結局。資料庫代表了全美超過70%的新診斷癌症病例和超過三千四百萬個歷史記錄。

⑵ icgc資料庫的數據需要log fpkm+1嘛

需要。
當我們使用TCGA表達數據，數據以gene-samplematrix形式整理好了，ICGC也是一個很大的癌症資料庫，存放了幾十種癌症的數據。我們需要將系數矩陣修改成gene-sample。

⑶ 常用的醫葯文獻檢索外文資料庫有哪些

1.Pubmed

是醫學,生命科學領域的資料庫,旨在組織、分享科研領域信息。為用戶提供文獻檢索,圖片檢索,影響因子查詢,免費全文下載,國家自然科學基金統計分析等服務

如果是校外沒有這些資料庫賬號，可以從seek68文獻館中找到。而且還省米。

⑷ 可切除 胃癌 PS=0 什麼意思

可切除胃癌，很好理解，就是胃癌可以做手術。PS0分這個是一個身體狀況評分，0分：活動能力完全正常，與起病前活動能力無任何差異。
1分：能自由走動及從事輕體力活動，包括一般家務或辦公室工作，但不能從事較重的體力活動。

2分：能自由走動及生活自理，但已喪失工作能力，日間不少於一半日間時間可以起床活動。

3分：生活僅能部分自理，日間一半以上時間卧床或坐輪椅。

4分: 卧床不起，生活不能自理。

5分: 死亡。

⑸ 中英文醫學文獻檢索的資料庫各有哪些

常見的英文醫學檢索資料庫：

1、Medline——世界上最著名的醫學文獻檢索系統之一

2、AIDS Databases——有關艾滋病的臨床實驗、葯物研製以及相關文獻資料庫

3、CANCERLIT——癌症資料庫(National Cancer Institute)

4、CHID online——綜合衛生信息資料庫，提供有關衛生、衛生教育資源的題錄、文摘等信息

5、ClinicalTrials.gov——向醫患人員提供的臨床實驗信息資料庫

6、DIRLINE——收集美國約17,000個政府機構、研究機構、公司、學術機構等信息

7、葯物信息庫——包含有9,000餘種美國處方與非處方葯物信息

8、HSTAT——包括有健康指南、評價、和消費者指南信息的全文資料庫

9、NCCAM Resources——補充和替代醫學資源

常見的中文醫學檢索資料庫：

1、中國知網——知網，是國家知識基礎設施的概念。

2、生物醫學文獻資料庫——中國醫科院信息研究所研製，綜合性生物醫學資料庫，國內權威。

3、中國科學引文索引資料庫——收集我國出版315種重要期刊，91-94年13萬篇論文及45萬引文摘要。

4、中醫中葯資料庫——中國科學院科學資料庫提供

5、中國中醫葯文獻檢索中心——由中國中醫研究院信息中心製作，提供中醫葯方面的Web界面文獻檢

⑹ seer資料庫的文章發不了了

需要獲取許可權。
這個資料庫是挺好的，很規范，癌症患者都登記在冊，這個系統最早是用於保險數據分析，現在有很多SCI文章是基於這個資料庫發表。
美國國家癌症研究所監測，流行病學和最終結果資料庫，簡稱SEER資料庫The Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program of the National Cancer Institute (NCI)。收錄范圍：美國部分州縣（約35％的美國人口）的發病率、死亡率和患病情況等信息。收錄變數：定期收集患者人口統計學、原發腫瘤部位、腫瘤形態、部分免疫組化、診斷階段、第一療程以及生存狀態隨訪的等臨床回顧性數據。收錄癌種：所涉及的腫瘤劃分為9類：乳腺、結直腸、其他消化系統、女性生殖、淋巴&白血病、男性生殖、呼吸系統、泌尿系統及其它尚未確指明的類型（最大的四個癌症組是肺癌，結腸癌/直腸癌，乳腺癌和前列腺癌。）數據更新：SEER提交的數據將在每年的十一月進行檢查，在第二年的四月份開放使用。

⑺ 分析miRNA的資料庫都有哪些

1、starBase

一個高通量實驗數據CLIP-Seq（或稱為HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解組測序數據支持的microRNA靶標資料庫,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的調控關系。整合和構建多個流行的靶標預測軟體的交集和調控關系。最新版本發布時間：2013年11月。

2、miRbase

眾所周知的microRNA基因注釋資料庫。目前miRBase只提供了microRNA的靶標的預測軟體的鏈接（如：PicTar）。最新版本發布時間：2010年9月。

3、ChIPBase

整合CLIP-Seq和ChIP-Seq的數據探討microRNA的轉錄和轉錄後調控，構建轉錄因子->microRNA->靶標的調控網路。最新版本發布時間：2012年11月。

4、Tarbase

一個收集已被實驗驗證的microRNA靶標資料庫。最新版本發布時間：2009年1月。

5、miRecords

一個整合的microRNA靶標資料庫。整合多個靶標預測軟體的調控關系。最新版本發布時間：2010年11月。

6、targetScan

基於靶mRNA序列的進化保守等特徵搜尋動物的microRNA靶基因。是預測microRNA靶標假陽性率較低的軟體。而且是microRNA領域大牛Bartel實驗室開發的。最新版本發布時間：2009年4月。

7、PicTar

基於microRNA或microRNA靶標聯合作用等特徵開發的搜尋動物的microRNA靶基因。假陽性率也較低。是microRNA領域大牛Rajewsky實驗室開發的。最新版本發布時間：2007年3月。

8、PITA

基於靶位點的可接性和自由能預測microRNA的靶標。是著名的生物信息學家Segal實驗室開發的。最新版本發布時間：2008年8月。

9、RNA22

基於序列特徵預測microRNA的結合位點。是幾個流行的microRNA靶標預測軟體的其中一個。IBM公司的研究團隊開發的。最新版本發布時間：2007年。

10、miRanda和microRNA.org

是著名的MemorialSloan-Kettering 癌症研究中心的研究人員開發的軟體和資料庫。miRanda的最新版本又叫mirSVR。最新版本發布時間：2010年8月。

11、MicroCosm

EMBL-EBI的Enright 實驗室開發的microRNA靶標資料庫。最新版本發布時間：2010年8月。

12、miRTarBase

整合實驗證實的microRNA靶標的資料庫。最新版本發布時間：2010年10月。

13、miRGator v2.0

整合microRNA表達、靶標和疾病相關信息的資料庫。最新版本發布時間：2010年11月。

14、MiRNAMap

動物的microRNA基因及其靶標的資料庫。最新版本發布時間：2008年1月。

15、miRDB

動物microRNA靶標預測和功能注釋資料庫。最新版本發布時間：2010年8月。

16、RNAhybrid

一個基於miRNA-target配對自由能預測microRNA的靶標。最新版本發布時間：2011年6月。

17、miRGen

microRNA基因和microRNA靶標資料庫。最新版本發布時間：2007年1月。

⑻ seer資料庫如何增加既往腫瘤信息

seer資料庫Breast Subtype ( 2010+ )」屬性增加既往腫瘤信息。
美國國家癌症研究所監測，流行病學和最終結果資料庫，簡稱SEER資料庫 [The Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program of the National Cancer Institute (NCI)]。

⑼ seer資料庫可以下保險信息嗎

seer資料庫可以下保險信息。
SEER 資料庫是由美國國立癌症研究所於 1973 年建立,是美國常用的癌症資料庫 ,裡麵包括各式各樣的腫瘤類型,如肺癌、乳腺癌、胃癌、結直腸癌、前列腺癌等等.

⑽ 美國SEER資料庫怎麼獲取 就是那個有很多癌症病人數據的資料庫，可以做研究發文章的，不知道怎麼獲取

這個資料庫是挺好的，美國人比我們做的更規范，癌症患者都登記在冊，這個系統最早是用於保險數據分析，現在有很多SCI文章是基於這個資料庫發表。也是國內學者尋求大數據支持的一個好地方。我也去找過，官方網站全英文太復雜了，你可以去Tao寶搜搜，有人願意幫忙的。我花過點錢，還是比較方便的。節約一個月的時間。現在這方面的數據文章被引用的比較多，所以雜志社比較願意收這個資料庫的文章。