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化合物資料庫

發布時間: 2023-02-12 14:17:12

① 化合物MDL號是什麼

貝爾斯坦號
Beilstein和Gmelin為當今世界上最龐大且享有盛譽的化合物數值與事實資料庫,該資料庫以電子方式提供包含可供檢索的化學結構和化學反應、相關的化學和物理性質,以及詳細的葯理學和生態學數據在內的最全面的信息資源。

CrossFire Gmelin是關於無機和金屬有機化合物的結構及相關化學、物理信息的資料庫。現由MDL Information Systems發行維護。該資料庫有兩個信息來源,其一是1817年至1975年Gmelin Handbook主要卷冊和補編的全部內容,另一個是1975年至今的111種涉及無機、金屬有機和物理化學的科學期刊。記錄內容為事實、結構、理化數據(包括各種參數)、書目數據等信息。

CrossFire Beilstein由MDL Information Systems GmbH,Beilstein Chemie Daten und Software GmbH推出。數據來源為1779年至1959年Beilstein Handbook從正編到第四補編的全部內容和1960年以來的原始文獻數據。原始文獻數據包括熔點、沸點、密度、折射率、旋光性、從自然產物或衍生物分離方法。該資料庫包含八百萬種有機化合物和五百多萬個反應。用戶可以用反應物或產物的結構或亞結構進行檢索,更可以用相關的化學、物理、生態、毒物學、葯理學特性、以及書目信息進行檢索。在反應式、文獻和引用化合物(如前體或組分)之間有超鏈接。

② 化學信息學的發展現狀

伴隨著葯物發現和製造技術發展而產生的化學信息學最早是由Frank Brown 用下述簡潔語言定義的:綜合信息資源,將數據(data)轉化為信息(information),將信息轉化為知識(knowledge),並將它用於特定葯物先導化合物的辨識和優化領域的一門學科。眾所周知,由於組合化學的出現使得葯物學發生了革命性的變化。現代葯物設計可以利用計算化學的方法,通過分子建模和模擬虛擬合成各種化合物(solid phase synthesis)。但是,通過這種方法得到的可供篩選的化合物庫非常龐大,理論上可以合成的類葯分子超過1040個。顯然,如果去實際合成每一個葯物來進行篩選是不可能的,因此必須從大量的數據中總結出規律,並利用這些規律進行虛擬的高通量篩選(HTS),以減少需要實際合成的化合物,同時盡可能地接近目標化合物。面對如此大量的數據,需要將原本獨立的化學、數學及計算機等學科融合起來,構建一系列計算技術工具,以便完成從數據到信息,從信息到知識的整個化學信息處理過程。這些技術工具不僅包括實驗數據的分析處理,同時也包括分子各種性質的計算、化合物資料庫的建立、分子的虛擬合成、QSAR的研究、化學結構和性質資料庫的建立、基於三維結構的分子設計、統計方法的研究等。化學信息學正是在上述需求基礎上發展起來的一門交叉學科。它綜合了數學、化學、生物學、信息學、計算機應用、葯物學等學科知識,主要研究如何適當地選取化合物庫(library)的多樣性(diversity)、如何表徵葯物分子特徵、如何度量不同分子間的差異性、如何識別類葯(drug like)分子、分子結構和生物性能(bioactivity)關系、如何研發相應的計算機軟硬體等,這就包括了化學計量學及計算化學的研究任務和內容。
化學信息學方法與傳統的化學計量學方法相比,更注重於有用信息的提取和更注重計算速度的提高。為滿足信息提取的需要,它大量採用了人工智慧領域和信息科學領域的先進方法和工具。例如,運用數據挖掘技術去發現大量原始數據中的隱含規則;運用特徵提取技術和編碼技術進行模式的表達;運用資料庫技術完成大型數據的儲存和搜索;運用計算機模擬技術模擬分子的合成,以及受體和配體之間的匹配等。而為滿足計算速度方面的要求,它一方面採用更高性能的計算機硬體,如並行計算機等;另一方面研究設計更為高效的演算法,以最大限度地利用計算機硬體所能提供的計算能力。顯然,化學信息學所研究的問題已經超越了傳統化學計量學所研究的范疇,現有的化學計量學方法難以解決分子設計研究領域大量出現的新問題。從這個意義上講,化學信息學的創立和發展是化學學科拓展的歷史必然。化學信息學在化學領域、化工領域、葯物設計領域、材料科學領域等許多領域中都已得到廣泛的應用。例如,在化工領域中,化學信息學被用來對反應條件進行優化和篩選催化劑等,這主要是通過對實驗數據進行建模,然後使用該預測模型實現對實驗工作的指導;在葯物設計領域,主要被用來進行分子模擬、虛擬合成、構效關系分析、虛擬篩選等;在材料科學領域,化學信息學被用於分子模擬和分子設計,並在分子性能預測的基礎上,從所設計的分子中篩選出進行實際合成的分子,以便得到經過性能優化的材料。

③ 上海有機化學研究所化學資料庫怎麼樣

肯定很全 有機所化學多厲害

④ 上海化學化工資料庫共享服務平台怎麼樣

挺全的,很好。
國家篩選中心與上海葯物所聯合設立了國家化合物樣品資料庫。
拓展資料:上海化學化工數據中心是上海研發公共服務平台下屬上海科技基礎資料庫的一個重要組成部分。上海化學化工數據中心的目標是通過中心的組建集成社會資源,建立化學化工領域的科學數據共享機制,探索化學化工數據共享標准和相關技術,為上海和華東地區所有與化學化工有關的研究機構、生產、銷售和使用單位提供公共信息平台和化學化工信息共享服務,降低研發成本,促進上海和長三角地區整體化學化工科技水平的提高。
上海化學化工數據中心將聯合上海地區擁有化學化工信息資源比較集中的單位,綜合現有信息資源,形成以基礎化學數據為核心向化工產品和醫葯化學品延伸的的化學化工資料庫群,建立化學化工信息服務平台和基本服務框架,通過Internet面向全社會提供化學化工信息的檢索服務,形成以華東為主包括全國的企業用戶群。
上海化學化工中心的服務平台是一個分布式的系統,每個合作單位都是一個服務節點,主節點依託上海有機化學研究所,通過上海化學化工數據中心的統一界面和標識進行服務。上海化學化工數據中心將借鑒相關單位的資料庫建設成功經驗,通過強化目標任務和合同管理協調參與單位的工作進展,通過聯合、互助完成項目的建設目標。

⑤ 摩貝化學網站的化合物百科是什麼類似化工大辭典嘛

官方對其化合物網路的說明:
摩貝化學品-化工詞典MOLBASE擁有全球最大、最精準的免費化合物資料庫,提供化學品名、CAS號、結構式等檢索方式,化工詞典全面涵蓋MSDS數據、合成路線、化工生產方法和用途

⑥ 分子資料庫的概述

本條目介紹一下全球免費讓公眾使用的化合物及葯物分子資料庫 ,對化學及葯物研究特別有用。
(注意: 以下信息來自於美國MedKoo Biosciences, Inc。)
1.美國國家醫學圖書館化學身份證(CHEMIDPLUS)資料庫
該網頁可檢索葯物化學結構,本網站可以用葯物名稱查找其化學結構. 此外,本資料庫還可以查看毒性, 理化性質, 葯品代碼等。
2. 美國國家醫學圖書館PUBCHEM資料庫可檢索葯物化學結構
本資料庫是美 國國家健康研究所(NIH)和美國國家醫學圖書館(NLM)的大型葯物分子庫。NIH 是美國醫學研究機構,下設27個機構和中心,也是美國健康與人類服務部的一個組成部分。它是一個重要的聯邦機構,執行和支持基礎、臨床及可轉化醫學研究, 調查普通及罕見疾病的原因、治療及治癒情況。PubChem資料庫是美國國家衛生署分子庫路線圖計劃的一個組成部分,是由NIH國家生物技術信心中心開發 的一個化學結構及分子生物活性綜合資料庫.
3。 美國國家癌症研究所(NCI)抗癌葯葯物詞典
該數據收集了4000多條與癌症醫學相關的術語和化合物性質。
4. 葯物合成資料庫(Drug SynthesisDatabase)
該數據是這個葯物在線網推出的數據 庫.本資料庫提供近7000種已上市或在研葯物的葯物合成相關的信息,如葯品名、結構式、化學名、CAS登記號、分子式、分子量、化學活性、開發階段、研 究機構等。最大的優點是快速檢索合成路線,並給出參考文獻來源。
檢索條件支持模糊查詢,各輸入條件間的檢索關系為邏輯與(即AND關系)。檢索條件選擇其一即可查詢。檢索方法包括:
*葯物名稱:(註:包含通用名、商標名、研發代號、異名等)。如Loratadine、Cefpirome.
*化學名稱:(註:包含CA命名、普通命名等)。
*CAS登記號:(註:美國化學文摘登記號)。
5. 有機合成方法資料庫
Since 1921, OrganicSyntheses has provided the chemistry community with annual collections ofdetailed, reliable, and carefully checked proceres for the synthesis oforganic compounds. Some proceres describe practical methods for thepreparation of specific compounds of interest, while other proceresillustrate important synthetic methods with general utility. Each procere iswritten in considerably more detail as compared to typical experimentalproceres in other journals, and each reaction and all characterization datahas been carefully checked for reprocibility in the laboratory ofa member of the Board of Editors.
Organic Synthesesproceres may be accessed either via the tables of contents of indivialvolumes (journal mode) or by concting structure and keywordsearches (database mode). Specific in divial proceres can beaccessed via the table of contents for either the original annual volume orcollective volume in which the procere appeared. Database modeallows users to simultaneously search all volumes of Organic Syntheses bykeywords or by inputting structures and substructures. Structure searchingrequires the ChemDraw plugin which can be downloaded according to theinstructions found in the left margin. Articles from future volumes of OrganicSyntheses that are not yet incorporated in the searchable database can beaccessed on the Org Syn Express page.
6. 有機合成人名反應
該資料庫是葯物在線網推出的數據 庫.TheOrganic Name Reactions (ONR) section is intended to serve the professionalchemist and student by describing organic chemical reactions which have come tobe recognized and referred to by name within the chemistry community. A selectgroup has been chosen for addition to this section. Each reaction descriptionis designed to be informative and representative of the pertinent literature;however, it is not meant to be comprehensive. The descriptions are composed ofthe following: (1) name(s) associated with the reaction, (2) the originaland/or primary contributor(s) connected with the discovery and/or developmentof the reaction, (3) a concise description of the transformation, (4) areaction scheme, (5) key references, and (6) cross references to other ONRbased on commonalities. The index included in this section also listssupplementary terms.
7. 有機合成反應庫
該數據可是這個葯物在線網推出的資料庫.含有400多個有機合成人名反應。
8. 化學物質索引資料庫(Chemical IndexDatabase)
該資料庫是葯物在線網推出的資料庫。 本資料庫為化學物質特性資料庫,包含大量具葯理活性及生物活性的物質性質信息數據。檢索條件支持模糊查詢,各輸入條件間的檢索關系為邏輯與(即AND關 系)。化學結構式為矢量格式圖片,可利用系統自帶圖片預覽工具或支持該格式的工具進行無損縮放查看。檢索結果包括:(a) 索引信息:如物質名稱、化學結構式圖、化學文摘登記號(CAS)、CA名稱、商標名、化學結構式、分子式、分子量、元素組成等。(b) 參考文獻:提供公開物質理化性質、制備方法、分析方法、葯理葯效、臨床研究等的重要期刊、專利、綜述等極具參考價值的文獻。(c) 物質特性:包括理化特性數據,如熔點、沸點、閃點、溶解性、多晶物質狀態、光譜吸收特徵數據、葯物治療分類等.
其檢索的方法有:
*物質名稱(英文名):(包含化學名、通用名、商標名、異名等的全名或部分(大於3個字元),如Ceftriaxone,Adefovir.)
*CA登記號(CAS Registry Number):
*注:美國化學文摘登記號
*參考文獻(Literature References)
*葯理活性(Keywords)
*用途(Usages)
*治療分類(Therapeutic Category)
*分子式(Molecular Formula)
*分子量(Molecular Weight)
*熔點(Melting Point)
*注:熔點值,以攝氏度為單位
*沸點(Boiling Point)
*注:沸點值,以攝氏度為單位
*解離常數(pKa)
*比旋度(Optical Rotation)
*油水分配系數(LogP)
*最大吸收值(Absorption Maximum)
*密度(Density)
*折光率(Index of Refraction)
*毒性數據(Toxicity)

⑦ 有機化學哪些資料庫比較好

有機化學類資料庫存儲的是與有機化學領域有關的各類信息。如關於有機化合物結構和各種性質的結構和事實庫I3F I LSTEIN ,關於有機化學反應的資料庫CASREACT, ChemlnformR},R},ACGS和CI I}.h'IREOCT ,關於CRC有機化學數據手冊的資料庫HUL7ClC等Chemical.AI、reaxys和Scifinder是有機合成常用的資料庫。reaxys有遺漏,Scifinder運行成本較高,產品價格不顯示。Chemical.AI是國產的非商業性的免費查合成路線工具。離線資料庫不大好吧,更新速度不能確定,信息接收速度會很慢的。資料庫(Database)是按照數據結構來組織、存儲和管理數據的倉庫,它產生於距今六十多年前,隨著信息技術和市場的發展,特別是二十世紀九十年代以後,數據管理不再僅僅是存儲和管理數據,而轉變成用戶所需要的各種數據管理的方式。資料庫有很多種類型,從最簡單的存儲有各種數據的表格到能夠進行海量數據存儲的大型資料庫系統都在各個方面得到了廣泛的應用。在信息化社會,充分有效地管理和利用各類信息資源,是進行科學研究和決策管理的前提條件。資料庫技術是管理信息系統、辦公自動化系統、決策支持系統等各類信息系統的核心部分,是進行科學研究和決策管理的重要技術手段。資料庫(Database)是按照數據結構來組織、存儲和管理數據的建立在計算機存儲設備上的倉庫。簡單來說是本身可視為電子化的文件櫃——存儲電子文件的處所,用戶可以對文件中的數據進行新增、截取、更新、刪除等操作。在經濟管理的日常工作中,常常需要把某些相關的數據放進這樣的「倉庫」,並根據管理的需要進行相應的處理。例如,企業或事業單位的人事部門常常要把本單位職工的基本情況(職工號、姓名、年齡、性別、籍貫、工資、簡歷等)存放在表中,這張表就可以看成是一個資料庫。有了這個"數據倉庫"我們就可以根據需要隨時查詢某職工的基本情況,也可以查詢工資在某個范圍內的職工人數等等。這些工作如果都能在計算機上自動進行,那我們的人事管理就可以達到極高的水平。此外,在財務管理、倉庫管理、生產管理中也需要建立眾多的這種"資料庫",使其可以利用計算機實現財務、倉庫、生產的自動化管理。

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