代謝組學資料庫

⑴ 為什麼之前在HMDB資料庫搜到的數據找不到了

你好，這個可能是sql服務沒開啟導致在HMDB的資料庫中搜不到數據了。 所以建議先進服務，開啟該服務。 如果還是無法開啟，就將把系統時間往前退幾天，再啟動服務試試。人類代謝組資料庫(HMDB)於2007年首次發布，被認為是人類代謝研究的標准代謝組學資源，包含有關人類代謝物高粗及其生物學作用、侍腔生理濃度、疾病相關性、化學反應、代謝途徑和參考光譜的綜合信息。HMDB包含114222個代謝物條目，包括水溶性和脂溶性代謝戚談鎮物以及被視為豐富（>1μm）或相對罕見（<1nm）的代謝物。

⑵ 1.求推薦一家靠譜的尿液代謝組學和血清代謝組學服務公司

1.百趣生物
成立時間：2012（最早是阿趣生物）
地點：上海
市場份額：14%
公司人數：約300人
公司介紹：國內最早專門從事代謝組學科研服務的公司之一，主打非靶標代謝組學檢測分析服務，其優勢是數據質量，據說能做到美國metabolon的水平，CV<10%。公司創始人源自於復旦大學及中科院，首席科學顧問為代謝組學學會秘書長、中科院朱研究員。
2.邁特維爾
成立時間：2015
地點：武漢
市場份額：14%
公司人數：約300人
公司介紹：國內最早專門從事農林作物代謝組學科研服務的公司之一，主打廣泛靶向代謝組學檢測分析服務，其優勢是植物天然產物資料庫比較完善，公司創始人源自於華中農業大學，首席科學顧問為原華中農業大學羅教授。
3.中科新生命代謝
成立時間：2004
地點：上海
市場份額：10%
公司人數：約300人
公司介紹：國內非常老牌的蛋白質組學公司，原來是中科院控股的企業，後來市場化，改由中科院營養與健康所參股，2017年左右開始做代謝組學。
4.諾禾致源質譜
成立時間：2011
地點：北京
市場份額：7%
公司人數：質譜團隊約150人
公司介紹：國內測序服務龍頭，2021年科創板上市，市值130億，2018年左右開始做代謝組學，優勢是銷售多，很容易找到。
5.鹿明生物
成立時間：2016
地點：上海
市場份額：7%
公司人數：約100人
公司介紹：歐易生物下屬企業，做蛋白質組學和代謝組學服務。歐易生物屬於老牌的基因測序服務企業，最近幾年發展的也很好。鹿明創始人是農科院的一名博士。

6.帕諾米克
成立時間：2012
地點：蘇州
市場份額：7%
公司人數：約150人
公司介紹：蘇州帕諾米克（BioNovoGene）最早是做基因檢測服務的，2017左右聚焦做代謝組學，改名為諾米代謝（PanoMIX），公司2021年獲得元生孝拆創投億級融資。
7.麥特繪譜
成立時間：2016
地點：上海
市場份額：5%
公司人數：約100人
公司介紹：原交通大學賈教授創立的科研服務公司，隨後賈教授在深圳設立了繪雲生物，收購了麥特繪譜。鑒於賈教授在代謝組學領域資深的影響力，麥特繪譜可以提供深度的服務。
8.凱萊譜
成立時間：2016
地點：杭州
市場份額：5%
公司人數：約100人
公司介紹：上市公司迪安診斷控股公司，最早與美國Metabolon建立技術合作。創始人來自Sciex資深應用專殲穗家。公司後來獨立融資，轉型為臨床診斷的公司，准備上市中。
9.中科脂典
成立時間：2015
地點：常州
市場份額：5%
公司人數：約50人
公司介紹：中科院遺傳與發育所參股企業，創始人為中科院稅研究員，稅老師是國內脂質組學領域非常有影響力的專家，所以公司也是比較專注做脂質組學。
10.拜譜生物
成立時間：2017
地點：上海
市場份額：5%
公司人數：約50人
公司介紹：氏慎卜拜譜生物提供蛋白質組學、代謝組學、基因組學和轉錄組學技術服務。創始人是從中科新生命出來的行業資深人士。

⑶ 代謝組學分析是幹嘛的

代謝組學分析如下：

一、代謝組學研究可分為兩類：「發現代謝組學」(也稱「非靶向代謝組學」)和「靶向代謝組學」。

1、「發現代謝組學」，也稱為非靶向代謝組學（untargeted metabolome）的目的是研究實驗組和對照組中有哪些代謝產物有統計學意義上的顯著差異，更多的是從定性和半定量角度發現「代謝組」上的差異，並對具有純輪顯著差異的化合物進行化學結構鑒定。

2、「靶向代謝組學」（targeted metabolome）的目的則是定量驗證特定代謝產物的表達差異。「靶向代謝組學」的研究對象是確定的一種或幾種代謝產物，並用大量的試驗樣本進行驗證做橘信，由於要進行定量研究，有可能會使用內標來制定標准曲線(絕對定量)。

二、代謝組學」的主流研究工具有伍空：

GC-MS（氣相色譜）

GC-MS是代謝組學研究的經典技術，具有技術成熟穩定、靈敏度高等特點，同時，由於具有相對完善的資料庫，使得定性也更為准確可靠，缺點則主要表現在樣品處理相對復雜，對於不易衍生化的物質定性和定量較困難。

LC-MS（液相色譜）

優勢主要表現在樣品制備和前處理簡單、實驗重復性好，靈敏度高，分離和分析范圍廣，缺點則主要表現在資料庫完善程度不夠，定性相對困難。

NMR（核磁共振）

最大的優勢是對樣品無破壞性，測定無偏向性，即適用於血液、尿液體液等液體樣品，也適用於組織和器官等固體樣品，並且測定速度快，可實現樣品代謝組的動態監測，缺點是靈敏度低。