體的資料庫
『壹』 代謝組學常用資料庫介紹
代謝組學資料庫是代謝組學檢測的關鍵,用於物質鑒定,以下是一些常用的代謝組學資料庫介紹。
一、人體代謝組資料庫(HMDB)
免費電子資料庫,包含人體小分子代謝產物信息,應用領域廣泛,如代謝組學、臨床化學、生物標志物發現,包含114,026個代謝物記錄。
二、METLIN
創建於2003年的METLIN資料庫,包含超過100萬個分子,包括脂類、類固醇等,數據在多種儀器上生成,包括SCIEX、安捷倫等。
三、MssBank
網路開放資料庫,公開分享從化學標准品得到的質譜圖,方便用戶鑒定代謝物,數據主要來自日本,包含代謝物質譜信息。
四、KEGG
收錄生物代謝物的代謝途徑,支持對代謝網路的搜尋及代謝途徑的映射,包含KEGG PATHWAY、KEGG DISEASA、KEGG COMPOUND等模塊。
五、LIPID MAPS
收錄生物相關脂質結構和注釋,包含超過40000個脂質結構,是世界上最大的公共脂質資料庫,脂質分為八個類別,下一級分類。
六、Golm Metabolome Database
收錄GC-MS平台代謝物分析信息,條目依據質譜圖和保留時間指數分類。
七、SYS-TOMONAS
提供系統生物學方法研究假單胞菌的生物信息學平台,包含轉錄組、蛋白組、代謝組和代謝重構信息。
八、BiGG
基因組及代謝網路重建的知識庫,集成70多個基因組級代謝網路,包含7339個代謝物,基因映射到NCBI注釋,代謝產物鏈接到多個外部資料庫。
九、MONA
自動管理存儲庫,高效存儲和查詢質譜記錄,包含實驗質譜和計算質譜,內含20多萬圖譜。
十、LipidSearch
Thermo Scientific LipidSearch軟體,用於從LC-MS數據識別和相對定量細胞脂質,功能包括與系統兼容、脂質資料庫、識別演算法等。
十一、BioSilico
整合各類代謝資料庫的網路平台,包括LIGAND、ENZYME、EcoCyyc和MetaCyc。
十二、Lipid Library
AOCS脂質庫,為學生、技術人員、科學家提供脂質科學和技術在線信息來源。
十三、NuGO
營養代謝組學資料庫,收錄人類營養代謝組學研究中使用的小分子物質。
十四、MetaCyc
實驗資料庫,闡明生命各領域的代謝途徑,包含3009種生物體的2722個途徑,目標是分類代謝領域。
『貳』 中國國家學生體質健康標准資料庫的介紹
中國國家學生體質健康標准資料庫(China National Student Health & Fitness Database,CNSHFD)是教育部為配合推廣《國家學生體質健康標准》的需要,於2004年開始建設的大型全國性學生體質健康測試數據的信息系統。數據來源於每年各級各類學校向教育部上報的學生體質健康標准測試結果。