全面資料庫

⑴ 超級全能的生信分析資料庫——GSCA

GSCA（Gene Set Cancer Analysis）是一個強大的癌症分析資料庫，囊括了單基因分析、多基因分析、免疫浸潤分析、突變分析以及葯物敏感性分析，提供全面的癌症研究工具。資料庫基於TCGA和GDSC的33種癌症類型數據，結合基因數據與臨床信息及750多種小分子葯物信息，為生物標志物挖掘和葯物開發提供重要支持，有助於實驗設計和臨床試驗指導。

GSCA資料庫主要分為四個模塊：基因表達模塊、免疫模塊、突變模塊和葯物模塊。

在基因表達模塊中，用戶可進行單基因分析和多基因/基因家族分析。通過選擇基因集、癌症類型和分析類型，提交請求後即可獲取基因表達差異結果。氣泡圖直觀展示腫瘤與正常組織間基因集表達差異，FC和FDR過濾條件確保結果的准確性和可靠性。用戶可點擊癌症名稱或基因名稱，查看差異表達情況，或查看基因集合的富集分數。

免疫模塊探索免疫細胞浸潤與基因組特徵之間的關系，包括mRNA表達、SNV、CNV和甲基化。用戶可分析基因表達與免疫細胞的相關性，通過氣泡圖直觀了解相關性和顯著性。單擊任意基因按鈕，可獲得與免疫細胞相關性的散點圖。

突變模塊聚焦基因集在不同癌症中的突變情況，分析基因突變與預後和基因表達量的關系。熱圖展示不同癌症中SNV頻率，點擊基因按鈕可查看突變具體信息。單基因SNV與生存分析提供預後情況，氣泡圖直觀顯示風險和統計顯著性。

葯物模塊研究mRNA表達與葯物敏感性之間的相關性，基於GDSC和CTRP資料庫。氣泡圖展示基因表達與葯物IC50的關聯，直觀顯示相關性和FDR顯著性。

GSCA為科研人員提供了一站式的癌症分析工具，簡化了數據處理和分析流程，降低了時間和人力成本。無論是基因集/基因家族分析、表達分析、預後分析、免疫分析、突變分析還是葯物敏感性分析，GSCA都是理想選擇。它簡化了復雜的數據分析過程，顯著提高了研究效率。

使用GSCA資料庫，科研人員能夠輕松生成高質量的圖表，無需深入編程知識。它不僅是一個強大的數據挖掘工具，更是基因研究、癌症分析和葯物開發的必備神器。通過GSCA，科研人員可以加速科研進程，探索更多生物標志物和潛在葯物，為癌症治療和預防提供科學依據。